Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q0

Rptor, Regulatory-associated protein of mTOR, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RptorQ8K4Q0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RptorQ8K4Q0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RptorQ8K4Q0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RptorQ8K4Q0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RptorQ8K4Q0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RptorQ8K4Q0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RptorQ8K4Q0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RptorQ8K4Q0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RptorQ8K4Q0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RptorQ8K4Q0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
RptorQ8K4Q0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RptorQ8K4Q0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RptorQ8K4Q0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RptorQ8K4Q0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
RptorQ8K4Q0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RptorQ8K4Q0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RptorQ8K4Q0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RptorQ8K4Q0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RptorQ8K4Q0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RptorQ8K4Q0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RptorQ8K4Q0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RptorQ8K4Q0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RptorQ8K4Q0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RptorQ8K4Q0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
RptorQ8K4Q0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RptorQ8K4Q0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RptorQ8K4Q0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RptorQ8K4Q0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RptorQ8K4Q0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RptorQ8K4Q0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RptorQ8K4Q0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RptorQ8K4Q0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RptorQ8K4Q0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RptorQ8K4Q0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RptorQ8K4Q0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RptorQ8K4Q0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RptorQ8K4Q0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RptorQ8K4Q0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RptorQ8K4Q0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RptorQ8K4Q0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RptorQ8K4Q0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RptorQ8K4Q0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RptorQ8K4Q0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RptorQ8K4Q0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RptorQ8K4Q0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RptorQ8K4Q0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RptorQ8K4Q0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RptorQ8K4Q0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RptorQ8K4Q0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RptorQ8K4Q0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RptorQ8K4Q0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RptorQ8K4Q0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RptorQ8K4Q0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RptorQ8K4Q0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RptorQ8K4Q0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RptorQ8K4Q0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RptorQ8K4Q0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RptorQ8K4Q0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RptorQ8K4Q0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RptorQ8K4Q0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RptorQ8K4Q0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
RptorQ8K4Q0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RptorQ8K4Q0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RptorQ8K4Q0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RptorQ8K4Q0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RptorQ8K4Q0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RptorQ8K4Q0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RptorQ8K4Q0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RptorQ8K4Q0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RptorQ8K4Q0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RptorQ8K4Q0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RptorQ8K4Q0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RptorQ8K4Q0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RptorQ8K4Q0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RptorQ8K4Q0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RptorQ8K4Q0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RptorQ8K4Q0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RptorQ8K4Q0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RptorQ8K4Q0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RptorQ8K4Q0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RptorQ8K4Q0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RptorQ8K4Q0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RptorQ8K4Q0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RptorQ8K4Q0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RptorQ8K4Q0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
RptorQ8K4Q0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RptorQ8K4Q0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RptorQ8K4Q0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RptorQ8K4Q0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RptorQ8K4Q0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RptorQ8K4Q0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RptorQ8K4Q0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RptorQ8K4Q0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RptorQ8K4Q0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RptorQ8K4Q0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RptorQ8K4Q0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RptorQ8K4Q0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RptorQ8K4Q0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RptorQ8K4Q0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RptorQ8K4Q0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms