Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3W3

Casc3, Protein CASC3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc3Q8K3W3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Casc3Q8K3W3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Casc3Q8K3W3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Casc3Q8K3W3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Casc3Q8K3W3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Casc3Q8K3W3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Casc3Q8K3W3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Casc3Q8K3W3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Casc3Q8K3W3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Casc3Q8K3W3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Casc3Q8K3W3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Casc3Q8K3W3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Casc3Q8K3W3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Casc3Q8K3W3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Casc3Q8K3W3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Casc3Q8K3W3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Casc3Q8K3W3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Casc3Q8K3W3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Casc3Q8K3W3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Casc3Q8K3W3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Casc3Q8K3W3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Casc3Q8K3W3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Casc3Q8K3W3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Casc3Q8K3W3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Casc3Q8K3W3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Casc3Q8K3W3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Casc3Q8K3W3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Casc3Q8K3W3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Casc3Q8K3W3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Casc3Q8K3W3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Casc3Q8K3W3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Casc3Q8K3W3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Casc3Q8K3W3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Casc3Q8K3W3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Casc3Q8K3W3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Casc3Q8K3W3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Casc3Q8K3W3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Casc3Q8K3W3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Casc3Q8K3W3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Casc3Q8K3W3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Casc3Q8K3W3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Casc3Q8K3W3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Casc3Q8K3W3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Casc3Q8K3W3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Casc3Q8K3W3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Casc3Q8K3W3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Casc3Q8K3W3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Casc3Q8K3W3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Casc3Q8K3W3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Casc3Q8K3W3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Casc3Q8K3W3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Casc3Q8K3W3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Casc3Q8K3W3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Casc3Q8K3W3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Casc3Q8K3W3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Casc3Q8K3W3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Casc3Q8K3W3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Casc3Q8K3W3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Casc3Q8K3W3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Casc3Q8K3W3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Casc3Q8K3W3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Casc3Q8K3W3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Casc3Q8K3W3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Casc3Q8K3W3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Casc3Q8K3W3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Casc3Q8K3W3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Casc3Q8K3W3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Casc3Q8K3W3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Casc3Q8K3W3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Casc3Q8K3W3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Casc3Q8K3W3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Casc3Q8K3W3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Casc3Q8K3W3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Casc3Q8K3W3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Casc3Q8K3W3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Casc3Q8K3W3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Casc3Q8K3W3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Casc3Q8K3W3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Casc3Q8K3W3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Casc3Q8K3W3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Casc3Q8K3W3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Casc3Q8K3W3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Casc3Q8K3W3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Casc3Q8K3W3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Casc3Q8K3W3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Casc3Q8K3W3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Casc3Q8K3W3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Casc3Q8K3W3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Casc3Q8K3W3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Casc3Q8K3W3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Casc3Q8K3W3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Casc3Q8K3W3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Casc3Q8K3W3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Casc3Q8K3W3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Casc3Q8K3W3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Casc3Q8K3W3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Casc3Q8K3W3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Casc3Q8K3W3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Casc3Q8K3W3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Casc3Q8K3W3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms