Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHT1

Ngef, Ephexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgefQ8CHT1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
NgefQ8CHT1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
NgefQ8CHT1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
NgefQ8CHT1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
NgefQ8CHT1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
NgefQ8CHT1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
NgefQ8CHT1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
NgefQ8CHT1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
NgefQ8CHT1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
NgefQ8CHT1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
NgefQ8CHT1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
NgefQ8CHT1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
NgefQ8CHT1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
NgefQ8CHT1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
NgefQ8CHT1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
NgefQ8CHT1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
NgefQ8CHT1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
NgefQ8CHT1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
NgefQ8CHT1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
NgefQ8CHT1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
NgefQ8CHT1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
NgefQ8CHT1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
NgefQ8CHT1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
NgefQ8CHT1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
NgefQ8CHT1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
NgefQ8CHT1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
NgefQ8CHT1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
NgefQ8CHT1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
NgefQ8CHT1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
NgefQ8CHT1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
NgefQ8CHT1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
NgefQ8CHT1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
NgefQ8CHT1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NgefQ8CHT1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
NgefQ8CHT1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
NgefQ8CHT1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
NgefQ8CHT1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
NgefQ8CHT1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
NgefQ8CHT1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
NgefQ8CHT1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
NgefQ8CHT1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
NgefQ8CHT1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NgefQ8CHT1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
NgefQ8CHT1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
NgefQ8CHT1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
NgefQ8CHT1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
NgefQ8CHT1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
NgefQ8CHT1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
NgefQ8CHT1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
NgefQ8CHT1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
NgefQ8CHT1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
NgefQ8CHT1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NgefQ8CHT1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NgefQ8CHT1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
NgefQ8CHT1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
NgefQ8CHT1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
NgefQ8CHT1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC34■■■■□ 3.03
NgefQ8CHT1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NgefQ8CHT1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NgefQ8CHT1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NgefQ8CHT1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
NgefQ8CHT1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
NgefQ8CHT1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
NgefQ8CHT1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC33.94■■■■□ 3.02
NgefQ8CHT1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
NgefQ8CHT1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
NgefQ8CHT1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
NgefQ8CHT1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
NgefQ8CHT1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
NgefQ8CHT1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
NgefQ8CHT1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
NgefQ8CHT1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
NgefQ8CHT1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
NgefQ8CHT1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
NgefQ8CHT1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
NgefQ8CHT1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
NgefQ8CHT1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
NgefQ8CHT1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NgefQ8CHT1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NgefQ8CHT1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NgefQ8CHT1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
NgefQ8CHT1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NgefQ8CHT1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
NgefQ8CHT1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC33.79■■■■□ 3
NgefQ8CHT1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
NgefQ8CHT1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
NgefQ8CHT1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■■□ 3
NgefQ8CHT1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
NgefQ8CHT1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
NgefQ8CHT1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NgefQ8CHT1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
NgefQ8CHT1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
NgefQ8CHT1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
NgefQ8CHT1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
NgefQ8CHT1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NgefQ8CHT1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NgefQ8CHT1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
NgefQ8CHT1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NgefQ8CHT1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
NgefQ8CHT1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms