Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC27

Cacnb2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb2Q8CC27 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cacnb2Q8CC27 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cacnb2Q8CC27 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Cacnb2Q8CC27 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cacnb2Q8CC27 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cacnb2Q8CC27 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cacnb2Q8CC27 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cacnb2Q8CC27 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cacnb2Q8CC27 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cacnb2Q8CC27 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cacnb2Q8CC27 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cacnb2Q8CC27 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cacnb2Q8CC27 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Cacnb2Q8CC27 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cacnb2Q8CC27 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cacnb2Q8CC27 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cacnb2Q8CC27 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cacnb2Q8CC27 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cacnb2Q8CC27 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cacnb2Q8CC27 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cacnb2Q8CC27 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Cacnb2Q8CC27 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cacnb2Q8CC27 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Cacnb2Q8CC27 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cacnb2Q8CC27 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cacnb2Q8CC27 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Cacnb2Q8CC27 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cacnb2Q8CC27 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cacnb2Q8CC27 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cacnb2Q8CC27 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cacnb2Q8CC27 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cacnb2Q8CC27 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cacnb2Q8CC27 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cacnb2Q8CC27 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cacnb2Q8CC27 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cacnb2Q8CC27 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cacnb2Q8CC27 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cacnb2Q8CC27 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Cacnb2Q8CC27 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cacnb2Q8CC27 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cacnb2Q8CC27 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cacnb2Q8CC27 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cacnb2Q8CC27 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cacnb2Q8CC27 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cacnb2Q8CC27 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cacnb2Q8CC27 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cacnb2Q8CC27 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cacnb2Q8CC27 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cacnb2Q8CC27 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cacnb2Q8CC27 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cacnb2Q8CC27 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cacnb2Q8CC27 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cacnb2Q8CC27 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cacnb2Q8CC27 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Cacnb2Q8CC27 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cacnb2Q8CC27 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cacnb2Q8CC27 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cacnb2Q8CC27 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cacnb2Q8CC27 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cacnb2Q8CC27 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cacnb2Q8CC27 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cacnb2Q8CC27 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cacnb2Q8CC27 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cacnb2Q8CC27 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cacnb2Q8CC27 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cacnb2Q8CC27 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cacnb2Q8CC27 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Cacnb2Q8CC27 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cacnb2Q8CC27 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cacnb2Q8CC27 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cacnb2Q8CC27 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cacnb2Q8CC27 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cacnb2Q8CC27 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cacnb2Q8CC27 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cacnb2Q8CC27 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cacnb2Q8CC27 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cacnb2Q8CC27 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cacnb2Q8CC27 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cacnb2Q8CC27 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cacnb2Q8CC27 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cacnb2Q8CC27 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cacnb2Q8CC27 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cacnb2Q8CC27 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cacnb2Q8CC27 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cacnb2Q8CC27 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cacnb2Q8CC27 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cacnb2Q8CC27 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cacnb2Q8CC27 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cacnb2Q8CC27 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cacnb2Q8CC27 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cacnb2Q8CC27 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cacnb2Q8CC27 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Cacnb2Q8CC27 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cacnb2Q8CC27 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cacnb2Q8CC27 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cacnb2Q8CC27 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cacnb2Q8CC27 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cacnb2Q8CC27 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cacnb2Q8CC27 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cacnb2Q8CC27 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 185.6 ms