Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9M2

Ccdc15, Coiled-coil domain-containing protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc15Q8C9M2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc15Q8C9M2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc15Q8C9M2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc15Q8C9M2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc15Q8C9M2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc15Q8C9M2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc15Q8C9M2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc15Q8C9M2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc15Q8C9M2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc15Q8C9M2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc15Q8C9M2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc15Q8C9M2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc15Q8C9M2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc15Q8C9M2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc15Q8C9M2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc15Q8C9M2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc15Q8C9M2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc15Q8C9M2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc15Q8C9M2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc15Q8C9M2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc15Q8C9M2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc15Q8C9M2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc15Q8C9M2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc15Q8C9M2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc15Q8C9M2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc15Q8C9M2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc15Q8C9M2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Ccdc15Q8C9M2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc15Q8C9M2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc15Q8C9M2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc15Q8C9M2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc15Q8C9M2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc15Q8C9M2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc15Q8C9M2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc15Q8C9M2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc15Q8C9M2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc15Q8C9M2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Ccdc15Q8C9M2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc15Q8C9M2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc15Q8C9M2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc15Q8C9M2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc15Q8C9M2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc15Q8C9M2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc15Q8C9M2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc15Q8C9M2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc15Q8C9M2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc15Q8C9M2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc15Q8C9M2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ccdc15Q8C9M2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ccdc15Q8C9M2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc15Q8C9M2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc15Q8C9M2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc15Q8C9M2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc15Q8C9M2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc15Q8C9M2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc15Q8C9M2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc15Q8C9M2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc15Q8C9M2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc15Q8C9M2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc15Q8C9M2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc15Q8C9M2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc15Q8C9M2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc15Q8C9M2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc15Q8C9M2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc15Q8C9M2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Ccdc15Q8C9M2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc15Q8C9M2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc15Q8C9M2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc15Q8C9M2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc15Q8C9M2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc15Q8C9M2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc15Q8C9M2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc15Q8C9M2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc15Q8C9M2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc15Q8C9M2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc15Q8C9M2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc15Q8C9M2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc15Q8C9M2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc15Q8C9M2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc15Q8C9M2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc15Q8C9M2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc15Q8C9M2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc15Q8C9M2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc15Q8C9M2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc15Q8C9M2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc15Q8C9M2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc15Q8C9M2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ccdc15Q8C9M2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc15Q8C9M2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc15Q8C9M2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc15Q8C9M2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc15Q8C9M2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc15Q8C9M2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc15Q8C9M2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc15Q8C9M2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc15Q8C9M2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc15Q8C9M2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc15Q8C9M2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc15Q8C9M2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc15Q8C9M2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms