Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQU6

Gjc2, Gap junction gamma-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc2Q8BQU6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gjc2Q8BQU6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gjc2Q8BQU6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gjc2Q8BQU6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gjc2Q8BQU6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gjc2Q8BQU6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gjc2Q8BQU6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gjc2Q8BQU6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gjc2Q8BQU6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gjc2Q8BQU6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gjc2Q8BQU6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gjc2Q8BQU6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gjc2Q8BQU6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gjc2Q8BQU6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gjc2Q8BQU6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gjc2Q8BQU6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gjc2Q8BQU6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gjc2Q8BQU6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gjc2Q8BQU6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gjc2Q8BQU6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gjc2Q8BQU6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Gjc2Q8BQU6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Gjc2Q8BQU6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gjc2Q8BQU6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gjc2Q8BQU6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gjc2Q8BQU6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gjc2Q8BQU6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gjc2Q8BQU6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gjc2Q8BQU6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gjc2Q8BQU6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gjc2Q8BQU6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gjc2Q8BQU6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gjc2Q8BQU6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gjc2Q8BQU6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gjc2Q8BQU6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gjc2Q8BQU6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gjc2Q8BQU6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gjc2Q8BQU6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gjc2Q8BQU6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gjc2Q8BQU6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gjc2Q8BQU6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gjc2Q8BQU6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gjc2Q8BQU6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gjc2Q8BQU6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gjc2Q8BQU6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gjc2Q8BQU6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gjc2Q8BQU6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gjc2Q8BQU6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gjc2Q8BQU6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gjc2Q8BQU6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gjc2Q8BQU6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gjc2Q8BQU6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gjc2Q8BQU6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gjc2Q8BQU6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gjc2Q8BQU6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gjc2Q8BQU6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gjc2Q8BQU6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gjc2Q8BQU6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gjc2Q8BQU6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gjc2Q8BQU6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gjc2Q8BQU6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gjc2Q8BQU6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gjc2Q8BQU6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gjc2Q8BQU6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Gjc2Q8BQU6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gjc2Q8BQU6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gjc2Q8BQU6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gjc2Q8BQU6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gjc2Q8BQU6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gjc2Q8BQU6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Gjc2Q8BQU6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gjc2Q8BQU6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gjc2Q8BQU6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gjc2Q8BQU6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gjc2Q8BQU6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gjc2Q8BQU6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Gjc2Q8BQU6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gjc2Q8BQU6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Gjc2Q8BQU6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gjc2Q8BQU6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gjc2Q8BQU6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gjc2Q8BQU6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gjc2Q8BQU6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gjc2Q8BQU6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gjc2Q8BQU6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gjc2Q8BQU6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gjc2Q8BQU6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Gjc2Q8BQU6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Gjc2Q8BQU6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Gjc2Q8BQU6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Gjc2Q8BQU6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Gjc2Q8BQU6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Gjc2Q8BQU6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Gjc2Q8BQU6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gjc2Q8BQU6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gjc2Q8BQU6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gjc2Q8BQU6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gjc2Q8BQU6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gjc2Q8BQU6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gjc2Q8BQU6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms