Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJ37

Tdp1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdp1Q8BJ37 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tdp1Q8BJ37 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tdp1Q8BJ37 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tdp1Q8BJ37 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tdp1Q8BJ37 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Tdp1Q8BJ37 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tdp1Q8BJ37 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tdp1Q8BJ37 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Tdp1Q8BJ37 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Tdp1Q8BJ37 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tdp1Q8BJ37 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tdp1Q8BJ37 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tdp1Q8BJ37 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tdp1Q8BJ37 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tdp1Q8BJ37 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tdp1Q8BJ37 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tdp1Q8BJ37 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tdp1Q8BJ37 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tdp1Q8BJ37 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tdp1Q8BJ37 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tdp1Q8BJ37 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tdp1Q8BJ37 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Tdp1Q8BJ37 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tdp1Q8BJ37 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Tdp1Q8BJ37 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tdp1Q8BJ37 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tdp1Q8BJ37 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tdp1Q8BJ37 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tdp1Q8BJ37 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tdp1Q8BJ37 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tdp1Q8BJ37 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tdp1Q8BJ37 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tdp1Q8BJ37 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tdp1Q8BJ37 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Tdp1Q8BJ37 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tdp1Q8BJ37 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tdp1Q8BJ37 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tdp1Q8BJ37 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tdp1Q8BJ37 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tdp1Q8BJ37 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tdp1Q8BJ37 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tdp1Q8BJ37 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tdp1Q8BJ37 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tdp1Q8BJ37 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tdp1Q8BJ37 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tdp1Q8BJ37 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tdp1Q8BJ37 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tdp1Q8BJ37 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tdp1Q8BJ37 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tdp1Q8BJ37 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tdp1Q8BJ37 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tdp1Q8BJ37 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tdp1Q8BJ37 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tdp1Q8BJ37 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tdp1Q8BJ37 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tdp1Q8BJ37 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tdp1Q8BJ37 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Tdp1Q8BJ37 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tdp1Q8BJ37 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tdp1Q8BJ37 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tdp1Q8BJ37 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tdp1Q8BJ37 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tdp1Q8BJ37 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tdp1Q8BJ37 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tdp1Q8BJ37 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tdp1Q8BJ37 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tdp1Q8BJ37 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tdp1Q8BJ37 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tdp1Q8BJ37 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tdp1Q8BJ37 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tdp1Q8BJ37 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tdp1Q8BJ37 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tdp1Q8BJ37 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tdp1Q8BJ37 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tdp1Q8BJ37 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tdp1Q8BJ37 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tdp1Q8BJ37 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tdp1Q8BJ37 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tdp1Q8BJ37 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tdp1Q8BJ37 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tdp1Q8BJ37 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tdp1Q8BJ37 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tdp1Q8BJ37 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tdp1Q8BJ37 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tdp1Q8BJ37 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Tdp1Q8BJ37 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Tdp1Q8BJ37 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Tdp1Q8BJ37 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tdp1Q8BJ37 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tdp1Q8BJ37 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tdp1Q8BJ37 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tdp1Q8BJ37 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tdp1Q8BJ37 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tdp1Q8BJ37 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tdp1Q8BJ37 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tdp1Q8BJ37 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tdp1Q8BJ37 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tdp1Q8BJ37 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tdp1Q8BJ37 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tdp1Q8BJ37 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms