Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2-M10.4Q85ZW8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2-M10.4Q85ZW8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-M10.4Q85ZW8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-M10.4Q85ZW8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-M10.4Q85ZW8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2-M10.4Q85ZW8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-M10.4Q85ZW8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-M10.4Q85ZW8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-M10.4Q85ZW8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-M10.4Q85ZW8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-M10.4Q85ZW8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-M10.4Q85ZW8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-M10.4Q85ZW8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2-M10.4Q85ZW8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
H2-M10.4Q85ZW8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
H2-M10.4Q85ZW8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
H2-M10.4Q85ZW8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2-M10.4Q85ZW8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2-M10.4Q85ZW8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2-M10.4Q85ZW8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2-M10.4Q85ZW8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2-M10.4Q85ZW8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
H2-M10.4Q85ZW8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
H2-M10.4Q85ZW8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
H2-M10.4Q85ZW8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2-M10.4Q85ZW8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2-M10.4Q85ZW8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2-M10.4Q85ZW8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2-M10.4Q85ZW8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2-M10.4Q85ZW8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2-M10.4Q85ZW8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2-M10.4Q85ZW8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H2-M10.4Q85ZW8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H2-M10.4Q85ZW8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H2-M10.4Q85ZW8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2-M10.4Q85ZW8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2-M10.4Q85ZW8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2-M10.4Q85ZW8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2-M10.4Q85ZW8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2-M10.4Q85ZW8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2-M10.4Q85ZW8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2-M10.4Q85ZW8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
H2-M10.4Q85ZW8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2-M10.4Q85ZW8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2-M10.4Q85ZW8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2-M10.4Q85ZW8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2-M10.4Q85ZW8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2-M10.4Q85ZW8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-M10.4Q85ZW8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-M10.4Q85ZW8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2-M10.4Q85ZW8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2-M10.4Q85ZW8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2-M10.4Q85ZW8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2-M10.4Q85ZW8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2-M10.4Q85ZW8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-M10.4Q85ZW8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-M10.4Q85ZW8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-M10.4Q85ZW8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2-M10.4Q85ZW8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2-M10.4Q85ZW8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2-M10.4Q85ZW8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2-M10.4Q85ZW8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-M10.4Q85ZW8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-M10.4Q85ZW8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-M10.4Q85ZW8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-M10.4Q85ZW8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2-M10.4Q85ZW8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-M10.4Q85ZW8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-M10.4Q85ZW8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
H2-M10.4Q85ZW8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
H2-M10.4Q85ZW8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H2-M10.4Q85ZW8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H2-M10.4Q85ZW8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
H2-M10.4Q85ZW8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
H2-M10.4Q85ZW8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.31■■□□□ 1
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.31■■□□□ 1
H2-M10.4Q85ZW8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
H2-M10.4Q85ZW8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
H2-M10.4Q85ZW8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2-M10.4Q85ZW8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2-M10.4Q85ZW8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.3■■□□□ 1
H2-M10.4Q85ZW8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2-M10.4Q85ZW8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H2-M10.4Q85ZW8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H2-M10.4Q85ZW8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
H2-M10.4Q85ZW8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.27■■□□□ 1
H2-M10.4Q85ZW8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
H2-M10.4Q85ZW8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H2-M10.4Q85ZW8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H2-M10.4Q85ZW8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2-M10.4Q85ZW8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2-M10.4Q85ZW8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2-M10.4Q85ZW8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-M10.4Q85ZW8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-M10.4Q85ZW8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-M10.4Q85ZW8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 159.4 ms