Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ChfrQ810L3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ChfrQ810L3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ChfrQ810L3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ChfrQ810L3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ChfrQ810L3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ChfrQ810L3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ChfrQ810L3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ChfrQ810L3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ChfrQ810L3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ChfrQ810L3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ChfrQ810L3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ChfrQ810L3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ChfrQ810L3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ChfrQ810L3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ChfrQ810L3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ChfrQ810L3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ChfrQ810L3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ChfrQ810L3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ChfrQ810L3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ChfrQ810L3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ChfrQ810L3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ChfrQ810L3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ChfrQ810L3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ChfrQ810L3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ChfrQ810L3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ChfrQ810L3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ChfrQ810L3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ChfrQ810L3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ChfrQ810L3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ChfrQ810L3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ChfrQ810L3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ChfrQ810L3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ChfrQ810L3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ChfrQ810L3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ChfrQ810L3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ChfrQ810L3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ChfrQ810L3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ChfrQ810L3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ChfrQ810L3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ChfrQ810L3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ChfrQ810L3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ChfrQ810L3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ChfrQ810L3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ChfrQ810L3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ChfrQ810L3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ChfrQ810L3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ChfrQ810L3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ChfrQ810L3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ChfrQ810L3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ChfrQ810L3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ChfrQ810L3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ChfrQ810L3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ChfrQ810L3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ChfrQ810L3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ChfrQ810L3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ChfrQ810L3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ChfrQ810L3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ChfrQ810L3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ChfrQ810L3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ChfrQ810L3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ChfrQ810L3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ChfrQ810L3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ChfrQ810L3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ChfrQ810L3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ChfrQ810L3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ChfrQ810L3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ChfrQ810L3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ChfrQ810L3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ChfrQ810L3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ChfrQ810L3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ChfrQ810L3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ChfrQ810L3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ChfrQ810L3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ChfrQ810L3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ChfrQ810L3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ChfrQ810L3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ChfrQ810L3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ChfrQ810L3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ChfrQ810L3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ChfrQ810L3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ChfrQ810L3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ChfrQ810L3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ChfrQ810L3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ChfrQ810L3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ChfrQ810L3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ChfrQ810L3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ChfrQ810L3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ChfrQ810L3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ChfrQ810L3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ChfrQ810L3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ChfrQ810L3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ChfrQ810L3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ChfrQ810L3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ChfrQ810L3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ChfrQ810L3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ChfrQ810L3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ChfrQ810L3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ChfrQ810L3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ChfrQ810L3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 156.3 ms