Protein–RNA interactions for Protein: Q80XI4

Pip4k2b, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 beta, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pip4k2bQ80XI4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Pip4k2bQ80XI4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Pip4k2bQ80XI4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Pip4k2bQ80XI4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Pip4k2bQ80XI4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Pip4k2bQ80XI4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Pip4k2bQ80XI4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Pip4k2bQ80XI4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
Pip4k2bQ80XI4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Pip4k2bQ80XI4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Pip4k2bQ80XI4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Pip4k2bQ80XI4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Pip4k2bQ80XI4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Pip4k2bQ80XI4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Pip4k2bQ80XI4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Pip4k2bQ80XI4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Pip4k2bQ80XI4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Pip4k2bQ80XI4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Pip4k2bQ80XI4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Pip4k2bQ80XI4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Pip4k2bQ80XI4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Pip4k2bQ80XI4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Pip4k2bQ80XI4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Pip4k2bQ80XI4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Pip4k2bQ80XI4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
Pip4k2bQ80XI4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Pip4k2bQ80XI4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Pip4k2bQ80XI4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Pip4k2bQ80XI4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Pip4k2bQ80XI4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Pip4k2bQ80XI4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Pip4k2bQ80XI4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Pip4k2bQ80XI4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Pip4k2bQ80XI4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Pip4k2bQ80XI4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Pip4k2bQ80XI4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Pip4k2bQ80XI4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Pip4k2bQ80XI4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Pip4k2bQ80XI4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Pip4k2bQ80XI4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Pip4k2bQ80XI4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Pip4k2bQ80XI4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Pip4k2bQ80XI4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Pip4k2bQ80XI4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Pip4k2bQ80XI4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Pip4k2bQ80XI4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Pip4k2bQ80XI4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Pip4k2bQ80XI4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Pip4k2bQ80XI4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Pip4k2bQ80XI4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Pip4k2bQ80XI4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Pip4k2bQ80XI4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Pip4k2bQ80XI4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Pip4k2bQ80XI4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Pip4k2bQ80XI4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Pip4k2bQ80XI4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Pip4k2bQ80XI4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC35.63■■■■□ 3.29
Pip4k2bQ80XI4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Pip4k2bQ80XI4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
Pip4k2bQ80XI4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Pip4k2bQ80XI4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Pip4k2bQ80XI4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Pip4k2bQ80XI4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Pip4k2bQ80XI4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
Pip4k2bQ80XI4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Pip4k2bQ80XI4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Pip4k2bQ80XI4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC35.57■■■■□ 3.28
Pip4k2bQ80XI4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Pip4k2bQ80XI4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Pip4k2bQ80XI4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
Pip4k2bQ80XI4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Pip4k2bQ80XI4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Pip4k2bQ80XI4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Pip4k2bQ80XI4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Pip4k2bQ80XI4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Pip4k2bQ80XI4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Pip4k2bQ80XI4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Pip4k2bQ80XI4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Pip4k2bQ80XI4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Pip4k2bQ80XI4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC35.51■■■■□ 3.28
Pip4k2bQ80XI4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Pip4k2bQ80XI4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Pip4k2bQ80XI4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Pip4k2bQ80XI4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Pip4k2bQ80XI4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Pip4k2bQ80XI4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Pip4k2bQ80XI4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
Pip4k2bQ80XI4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Pip4k2bQ80XI4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Pip4k2bQ80XI4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Pip4k2bQ80XI4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Pip4k2bQ80XI4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Pip4k2bQ80XI4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
Pip4k2bQ80XI4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
Pip4k2bQ80XI4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Pip4k2bQ80XI4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
Pip4k2bQ80XI4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
Pip4k2bQ80XI4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
Pip4k2bQ80XI4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Pip4k2bQ80XI4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms