Protein–RNA interactions for Protein: Q80W85

Npm2, Nucleoplasmin-2, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm2Q80W85 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC40.76■■■■■ 4.12
Npm2Q80W85 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
Npm2Q80W85 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
Npm2Q80W85 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
Npm2Q80W85 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
Npm2Q80W85 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
Npm2Q80W85 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC40.71■■■■■ 4.11
Npm2Q80W85 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
Npm2Q80W85 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC40.68■■■■■ 4.1
Npm2Q80W85 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC40.68■■■■■ 4.1
Npm2Q80W85 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
Npm2Q80W85 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
Npm2Q80W85 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC40.64■■■■■ 4.1
Npm2Q80W85 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
Npm2Q80W85 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC40.63■■■■■ 4.09
Npm2Q80W85 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
Npm2Q80W85 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
Npm2Q80W85 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.61■■■■■ 4.09
Npm2Q80W85 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
Npm2Q80W85 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
Npm2Q80W85 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
Npm2Q80W85 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.58■■■■■ 4.09
Npm2Q80W85 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
Npm2Q80W85 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
Npm2Q80W85 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.55■■■■■ 4.08
Npm2Q80W85 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
Npm2Q80W85 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
Npm2Q80W85 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
Npm2Q80W85 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC40.52■■■■■ 4.08
Npm2Q80W85 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
Npm2Q80W85 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
Npm2Q80W85 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
Npm2Q80W85 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC40.48■■■■■ 4.07
Npm2Q80W85 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
Npm2Q80W85 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
Npm2Q80W85 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC40.46■■■■■ 4.07
Npm2Q80W85 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC40.46■■■■■ 4.07
Npm2Q80W85 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
Npm2Q80W85 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
Npm2Q80W85 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
Npm2Q80W85 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
Npm2Q80W85 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
Npm2Q80W85 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
Npm2Q80W85 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
Npm2Q80W85 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
Npm2Q80W85 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
Npm2Q80W85 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
Npm2Q80W85 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
Npm2Q80W85 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
Npm2Q80W85 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
Npm2Q80W85 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
Npm2Q80W85 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
Npm2Q80W85 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC40.33■■■■■ 4.05
Npm2Q80W85 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
Npm2Q80W85 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
Npm2Q80W85 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
Npm2Q80W85 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
Npm2Q80W85 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
Npm2Q80W85 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC40.24■■■■■ 4.03
Npm2Q80W85 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
Npm2Q80W85 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.23■■■■■ 4.03
Npm2Q80W85 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
Npm2Q80W85 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
Npm2Q80W85 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
Npm2Q80W85 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
Npm2Q80W85 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
Npm2Q80W85 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC40.19■■■■■ 4.02
Npm2Q80W85 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC40.19■■■■■ 4.02
Npm2Q80W85 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
Npm2Q80W85 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
Npm2Q80W85 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.02
Npm2Q80W85 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
Npm2Q80W85 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
Npm2Q80W85 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC40.11■■■■■ 4.01
Npm2Q80W85 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC40.1■■■■■ 4.01
Npm2Q80W85 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
Npm2Q80W85 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
Npm2Q80W85 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.06■■■■■ 4
Npm2Q80W85 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
Npm2Q80W85 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC40.05■■■■■ 4
Npm2Q80W85 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
Npm2Q80W85 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
Npm2Q80W85 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC40.02■■■■■ 4
Npm2Q80W85 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
Npm2Q80W85 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
Npm2Q80W85 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC40.01■■■■□ 3.99
Npm2Q80W85 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.99■■■■□ 3.99
Npm2Q80W85 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC39.99■■■■□ 3.99
Npm2Q80W85 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.98■■■■□ 3.99
Npm2Q80W85 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC39.98■■■■□ 3.99
Npm2Q80W85 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
Npm2Q80W85 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
Npm2Q80W85 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
Npm2Q80W85 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
Npm2Q80W85 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
Npm2Q80W85 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
Npm2Q80W85 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
Npm2Q80W85 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
Npm2Q80W85 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
Npm2Q80W85 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms