Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ttc29Q80VM3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ttc29Q80VM3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ttc29Q80VM3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ttc29Q80VM3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ttc29Q80VM3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ttc29Q80VM3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ttc29Q80VM3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ttc29Q80VM3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ttc29Q80VM3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ttc29Q80VM3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ttc29Q80VM3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ttc29Q80VM3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ttc29Q80VM3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ttc29Q80VM3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ttc29Q80VM3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ttc29Q80VM3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ttc29Q80VM3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ttc29Q80VM3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ttc29Q80VM3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ttc29Q80VM3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ttc29Q80VM3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ttc29Q80VM3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ttc29Q80VM3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ttc29Q80VM3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ttc29Q80VM3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ttc29Q80VM3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ttc29Q80VM3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ttc29Q80VM3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ttc29Q80VM3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ttc29Q80VM3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ttc29Q80VM3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ttc29Q80VM3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ttc29Q80VM3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttc29Q80VM3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttc29Q80VM3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttc29Q80VM3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttc29Q80VM3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ttc29Q80VM3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ttc29Q80VM3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ttc29Q80VM3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttc29Q80VM3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttc29Q80VM3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ttc29Q80VM3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ttc29Q80VM3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ttc29Q80VM3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Ttc29Q80VM3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttc29Q80VM3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttc29Q80VM3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttc29Q80VM3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttc29Q80VM3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ttc29Q80VM3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ttc29Q80VM3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ttc29Q80VM3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ttc29Q80VM3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ttc29Q80VM3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ttc29Q80VM3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ttc29Q80VM3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ttc29Q80VM3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ttc29Q80VM3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ttc29Q80VM3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ttc29Q80VM3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ttc29Q80VM3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ttc29Q80VM3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttc29Q80VM3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttc29Q80VM3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttc29Q80VM3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttc29Q80VM3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttc29Q80VM3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ttc29Q80VM3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ttc29Q80VM3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ttc29Q80VM3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ttc29Q80VM3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ttc29Q80VM3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ttc29Q80VM3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ttc29Q80VM3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ttc29Q80VM3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ttc29Q80VM3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ttc29Q80VM3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ttc29Q80VM3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ttc29Q80VM3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ttc29Q80VM3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ttc29Q80VM3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ttc29Q80VM3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ttc29Q80VM3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ttc29Q80VM3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ttc29Q80VM3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ttc29Q80VM3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ttc29Q80VM3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ttc29Q80VM3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ttc29Q80VM3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ttc29Q80VM3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ttc29Q80VM3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ttc29Q80VM3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ttc29Q80VM3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttc29Q80VM3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttc29Q80VM3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttc29Q80VM3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttc29Q80VM3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc29Q80VM3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
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