Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Avl9Q80U56 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Avl9Q80U56 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Avl9Q80U56 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Avl9Q80U56 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Avl9Q80U56 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Avl9Q80U56 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Avl9Q80U56 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Avl9Q80U56 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Avl9Q80U56 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Avl9Q80U56 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Avl9Q80U56 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Avl9Q80U56 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Avl9Q80U56 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Avl9Q80U56 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Avl9Q80U56 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Avl9Q80U56 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Avl9Q80U56 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Avl9Q80U56 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Avl9Q80U56 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Avl9Q80U56 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Avl9Q80U56 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Avl9Q80U56 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Avl9Q80U56 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Avl9Q80U56 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Avl9Q80U56 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Avl9Q80U56 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Avl9Q80U56 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Avl9Q80U56 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Avl9Q80U56 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Avl9Q80U56 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Avl9Q80U56 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Avl9Q80U56 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Avl9Q80U56 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Avl9Q80U56 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Avl9Q80U56 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Avl9Q80U56 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Avl9Q80U56 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Avl9Q80U56 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Avl9Q80U56 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Avl9Q80U56 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Avl9Q80U56 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Avl9Q80U56 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Avl9Q80U56 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Avl9Q80U56 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Avl9Q80U56 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Avl9Q80U56 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Avl9Q80U56 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Avl9Q80U56 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Avl9Q80U56 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Avl9Q80U56 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Avl9Q80U56 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Avl9Q80U56 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Avl9Q80U56 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Avl9Q80U56 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Avl9Q80U56 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Avl9Q80U56 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Avl9Q80U56 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Avl9Q80U56 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Avl9Q80U56 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Avl9Q80U56 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Avl9Q80U56 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Avl9Q80U56 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Avl9Q80U56 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Avl9Q80U56 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Avl9Q80U56 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Avl9Q80U56 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Avl9Q80U56 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Avl9Q80U56 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Avl9Q80U56 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Avl9Q80U56 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Avl9Q80U56 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Avl9Q80U56 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Avl9Q80U56 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Avl9Q80U56 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Avl9Q80U56 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Avl9Q80U56 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Avl9Q80U56 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Avl9Q80U56 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Avl9Q80U56 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Avl9Q80U56 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Avl9Q80U56 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Avl9Q80U56 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Avl9Q80U56 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Avl9Q80U56 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Avl9Q80U56 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Avl9Q80U56 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Avl9Q80U56 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Avl9Q80U56 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Avl9Q80U56 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Avl9Q80U56 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Avl9Q80U56 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Avl9Q80U56 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Avl9Q80U56 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Avl9Q80U56 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Avl9Q80U56 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Avl9Q80U56 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Avl9Q80U56 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Avl9Q80U56 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Avl9Q80U56 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms