Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT18

Atf7ip, Activating transcription factor 7-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf7ipQ7TT18 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Atf7ipQ7TT18 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Atf7ipQ7TT18 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
Atf7ipQ7TT18 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Atf7ipQ7TT18 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Atf7ipQ7TT18 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Atf7ipQ7TT18 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
Atf7ipQ7TT18 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Atf7ipQ7TT18 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
Atf7ipQ7TT18 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Atf7ipQ7TT18 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Atf7ipQ7TT18 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Atf7ipQ7TT18 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Atf7ipQ7TT18 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Atf7ipQ7TT18 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Atf7ipQ7TT18 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Atf7ipQ7TT18 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
Atf7ipQ7TT18 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
Atf7ipQ7TT18 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Atf7ipQ7TT18 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Atf7ipQ7TT18 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Atf7ipQ7TT18 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Atf7ipQ7TT18 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Atf7ipQ7TT18 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Atf7ipQ7TT18 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Atf7ipQ7TT18 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Atf7ipQ7TT18 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Atf7ipQ7TT18 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Atf7ipQ7TT18 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Atf7ipQ7TT18 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Atf7ipQ7TT18 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Atf7ipQ7TT18 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Atf7ipQ7TT18 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Atf7ipQ7TT18 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Atf7ipQ7TT18 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Atf7ipQ7TT18 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Atf7ipQ7TT18 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Atf7ipQ7TT18 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Atf7ipQ7TT18 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Atf7ipQ7TT18 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Atf7ipQ7TT18 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Atf7ipQ7TT18 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Atf7ipQ7TT18 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Atf7ipQ7TT18 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Atf7ipQ7TT18 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Atf7ipQ7TT18 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
Atf7ipQ7TT18 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.85
Atf7ipQ7TT18 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
Atf7ipQ7TT18 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Atf7ipQ7TT18 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
Atf7ipQ7TT18 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Atf7ipQ7TT18 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Atf7ipQ7TT18 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Atf7ipQ7TT18 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Atf7ipQ7TT18 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Atf7ipQ7TT18 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Atf7ipQ7TT18 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Atf7ipQ7TT18 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Atf7ipQ7TT18 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Atf7ipQ7TT18 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Atf7ipQ7TT18 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
Atf7ipQ7TT18 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Atf7ipQ7TT18 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Atf7ipQ7TT18 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Atf7ipQ7TT18 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Atf7ipQ7TT18 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Atf7ipQ7TT18 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Atf7ipQ7TT18 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Atf7ipQ7TT18 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Atf7ipQ7TT18 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Atf7ipQ7TT18 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
Atf7ipQ7TT18 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Atf7ipQ7TT18 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Atf7ipQ7TT18 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Atf7ipQ7TT18 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Atf7ipQ7TT18 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Atf7ipQ7TT18 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Atf7ipQ7TT18 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Atf7ipQ7TT18 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Atf7ipQ7TT18 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Atf7ipQ7TT18 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Atf7ipQ7TT18 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
Atf7ipQ7TT18 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Atf7ipQ7TT18 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Atf7ipQ7TT18 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Atf7ipQ7TT18 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Atf7ipQ7TT18 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Atf7ipQ7TT18 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Atf7ipQ7TT18 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Atf7ipQ7TT18 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Atf7ipQ7TT18 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Atf7ipQ7TT18 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Atf7ipQ7TT18 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Atf7ipQ7TT18 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Atf7ipQ7TT18 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Atf7ipQ7TT18 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Atf7ipQ7TT18 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Atf7ipQ7TT18 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Atf7ipQ7TT18 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Atf7ipQ7TT18 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms