Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sgo2Q7TSY8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sgo2Q7TSY8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sgo2Q7TSY8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sgo2Q7TSY8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sgo2Q7TSY8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sgo2Q7TSY8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Sgo2Q7TSY8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sgo2Q7TSY8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sgo2Q7TSY8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sgo2Q7TSY8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sgo2Q7TSY8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sgo2Q7TSY8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sgo2Q7TSY8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Sgo2Q7TSY8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sgo2Q7TSY8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Sgo2Q7TSY8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Sgo2Q7TSY8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sgo2Q7TSY8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sgo2Q7TSY8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sgo2Q7TSY8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sgo2Q7TSY8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sgo2Q7TSY8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sgo2Q7TSY8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sgo2Q7TSY8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sgo2Q7TSY8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sgo2Q7TSY8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sgo2Q7TSY8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sgo2Q7TSY8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sgo2Q7TSY8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sgo2Q7TSY8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sgo2Q7TSY8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sgo2Q7TSY8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sgo2Q7TSY8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sgo2Q7TSY8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sgo2Q7TSY8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sgo2Q7TSY8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sgo2Q7TSY8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sgo2Q7TSY8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sgo2Q7TSY8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sgo2Q7TSY8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sgo2Q7TSY8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sgo2Q7TSY8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sgo2Q7TSY8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sgo2Q7TSY8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sgo2Q7TSY8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Sgo2Q7TSY8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sgo2Q7TSY8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sgo2Q7TSY8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Sgo2Q7TSY8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sgo2Q7TSY8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sgo2Q7TSY8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sgo2Q7TSY8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sgo2Q7TSY8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sgo2Q7TSY8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sgo2Q7TSY8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sgo2Q7TSY8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sgo2Q7TSY8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sgo2Q7TSY8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sgo2Q7TSY8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sgo2Q7TSY8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sgo2Q7TSY8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sgo2Q7TSY8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sgo2Q7TSY8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sgo2Q7TSY8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sgo2Q7TSY8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sgo2Q7TSY8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sgo2Q7TSY8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sgo2Q7TSY8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sgo2Q7TSY8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sgo2Q7TSY8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sgo2Q7TSY8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sgo2Q7TSY8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sgo2Q7TSY8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sgo2Q7TSY8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sgo2Q7TSY8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sgo2Q7TSY8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sgo2Q7TSY8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sgo2Q7TSY8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sgo2Q7TSY8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sgo2Q7TSY8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sgo2Q7TSY8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sgo2Q7TSY8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sgo2Q7TSY8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sgo2Q7TSY8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sgo2Q7TSY8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sgo2Q7TSY8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sgo2Q7TSY8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sgo2Q7TSY8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sgo2Q7TSY8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sgo2Q7TSY8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sgo2Q7TSY8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sgo2Q7TSY8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sgo2Q7TSY8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sgo2Q7TSY8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Sgo2Q7TSY8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sgo2Q7TSY8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Sgo2Q7TSY8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sgo2Q7TSY8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sgo2Q7TSY8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms