Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Clec18aQ7TSQ1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clec18aQ7TSQ1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clec18aQ7TSQ1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clec18aQ7TSQ1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Clec18aQ7TSQ1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Clec18aQ7TSQ1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clec18aQ7TSQ1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clec18aQ7TSQ1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clec18aQ7TSQ1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clec18aQ7TSQ1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clec18aQ7TSQ1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clec18aQ7TSQ1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clec18aQ7TSQ1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Clec18aQ7TSQ1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clec18aQ7TSQ1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Clec18aQ7TSQ1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Clec18aQ7TSQ1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Clec18aQ7TSQ1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clec18aQ7TSQ1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clec18aQ7TSQ1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clec18aQ7TSQ1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clec18aQ7TSQ1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Clec18aQ7TSQ1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clec18aQ7TSQ1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clec18aQ7TSQ1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Clec18aQ7TSQ1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clec18aQ7TSQ1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clec18aQ7TSQ1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clec18aQ7TSQ1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clec18aQ7TSQ1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clec18aQ7TSQ1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clec18aQ7TSQ1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Clec18aQ7TSQ1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Clec18aQ7TSQ1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clec18aQ7TSQ1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clec18aQ7TSQ1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clec18aQ7TSQ1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clec18aQ7TSQ1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clec18aQ7TSQ1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clec18aQ7TSQ1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clec18aQ7TSQ1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clec18aQ7TSQ1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clec18aQ7TSQ1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clec18aQ7TSQ1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clec18aQ7TSQ1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clec18aQ7TSQ1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Clec18aQ7TSQ1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clec18aQ7TSQ1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clec18aQ7TSQ1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Clec18aQ7TSQ1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Clec18aQ7TSQ1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Clec18aQ7TSQ1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Clec18aQ7TSQ1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Clec18aQ7TSQ1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clec18aQ7TSQ1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clec18aQ7TSQ1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clec18aQ7TSQ1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clec18aQ7TSQ1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clec18aQ7TSQ1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clec18aQ7TSQ1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clec18aQ7TSQ1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clec18aQ7TSQ1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clec18aQ7TSQ1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clec18aQ7TSQ1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clec18aQ7TSQ1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clec18aQ7TSQ1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clec18aQ7TSQ1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clec18aQ7TSQ1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clec18aQ7TSQ1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Clec18aQ7TSQ1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clec18aQ7TSQ1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clec18aQ7TSQ1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clec18aQ7TSQ1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clec18aQ7TSQ1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clec18aQ7TSQ1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clec18aQ7TSQ1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clec18aQ7TSQ1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clec18aQ7TSQ1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clec18aQ7TSQ1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clec18aQ7TSQ1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clec18aQ7TSQ1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clec18aQ7TSQ1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clec18aQ7TSQ1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clec18aQ7TSQ1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clec18aQ7TSQ1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clec18aQ7TSQ1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clec18aQ7TSQ1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clec18aQ7TSQ1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clec18aQ7TSQ1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clec18aQ7TSQ1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clec18aQ7TSQ1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clec18aQ7TSQ1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clec18aQ7TSQ1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clec18aQ7TSQ1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clec18aQ7TSQ1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clec18aQ7TSQ1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Clec18aQ7TSQ1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Clec18aQ7TSQ1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clec18aQ7TSQ1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms