Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Actn1Q7TPR4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Actn1Q7TPR4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Actn1Q7TPR4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Actn1Q7TPR4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Actn1Q7TPR4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Actn1Q7TPR4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Actn1Q7TPR4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Actn1Q7TPR4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Actn1Q7TPR4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Actn1Q7TPR4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Actn1Q7TPR4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Actn1Q7TPR4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Actn1Q7TPR4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Actn1Q7TPR4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Actn1Q7TPR4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Actn1Q7TPR4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Actn1Q7TPR4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Actn1Q7TPR4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Actn1Q7TPR4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Actn1Q7TPR4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Actn1Q7TPR4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Actn1Q7TPR4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Actn1Q7TPR4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Actn1Q7TPR4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Actn1Q7TPR4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Actn1Q7TPR4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Actn1Q7TPR4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Actn1Q7TPR4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Actn1Q7TPR4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Actn1Q7TPR4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Actn1Q7TPR4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Actn1Q7TPR4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Actn1Q7TPR4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Actn1Q7TPR4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Actn1Q7TPR4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Actn1Q7TPR4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Actn1Q7TPR4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Actn1Q7TPR4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Actn1Q7TPR4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Actn1Q7TPR4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Actn1Q7TPR4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Actn1Q7TPR4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Actn1Q7TPR4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Actn1Q7TPR4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Actn1Q7TPR4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Actn1Q7TPR4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Actn1Q7TPR4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Actn1Q7TPR4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Actn1Q7TPR4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Actn1Q7TPR4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Actn1Q7TPR4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Actn1Q7TPR4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Actn1Q7TPR4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Actn1Q7TPR4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Actn1Q7TPR4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Actn1Q7TPR4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Actn1Q7TPR4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Actn1Q7TPR4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Actn1Q7TPR4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Actn1Q7TPR4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Actn1Q7TPR4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Actn1Q7TPR4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Actn1Q7TPR4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Actn1Q7TPR4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Actn1Q7TPR4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Actn1Q7TPR4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Actn1Q7TPR4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Actn1Q7TPR4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Actn1Q7TPR4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Actn1Q7TPR4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Actn1Q7TPR4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Actn1Q7TPR4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Actn1Q7TPR4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Actn1Q7TPR4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Actn1Q7TPR4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Actn1Q7TPR4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Actn1Q7TPR4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Actn1Q7TPR4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Actn1Q7TPR4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Actn1Q7TPR4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Actn1Q7TPR4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Actn1Q7TPR4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Actn1Q7TPR4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Actn1Q7TPR4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Actn1Q7TPR4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Actn1Q7TPR4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Actn1Q7TPR4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Actn1Q7TPR4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Actn1Q7TPR4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Actn1Q7TPR4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Actn1Q7TPR4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Actn1Q7TPR4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Actn1Q7TPR4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Actn1Q7TPR4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Actn1Q7TPR4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Actn1Q7TPR4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Actn1Q7TPR4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Actn1Q7TPR4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Actn1Q7TPR4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms