Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMK9

Syncrip, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncripQ7TMK9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SyncripQ7TMK9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SyncripQ7TMK9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SyncripQ7TMK9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SyncripQ7TMK9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SyncripQ7TMK9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SyncripQ7TMK9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SyncripQ7TMK9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SyncripQ7TMK9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SyncripQ7TMK9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SyncripQ7TMK9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SyncripQ7TMK9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SyncripQ7TMK9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SyncripQ7TMK9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SyncripQ7TMK9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SyncripQ7TMK9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SyncripQ7TMK9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SyncripQ7TMK9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SyncripQ7TMK9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SyncripQ7TMK9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SyncripQ7TMK9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SyncripQ7TMK9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SyncripQ7TMK9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SyncripQ7TMK9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SyncripQ7TMK9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SyncripQ7TMK9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SyncripQ7TMK9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SyncripQ7TMK9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SyncripQ7TMK9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SyncripQ7TMK9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SyncripQ7TMK9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SyncripQ7TMK9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SyncripQ7TMK9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SyncripQ7TMK9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SyncripQ7TMK9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SyncripQ7TMK9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SyncripQ7TMK9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SyncripQ7TMK9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SyncripQ7TMK9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SyncripQ7TMK9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SyncripQ7TMK9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SyncripQ7TMK9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SyncripQ7TMK9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SyncripQ7TMK9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SyncripQ7TMK9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SyncripQ7TMK9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SyncripQ7TMK9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SyncripQ7TMK9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SyncripQ7TMK9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SyncripQ7TMK9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SyncripQ7TMK9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SyncripQ7TMK9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SyncripQ7TMK9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SyncripQ7TMK9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SyncripQ7TMK9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SyncripQ7TMK9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SyncripQ7TMK9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SyncripQ7TMK9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SyncripQ7TMK9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SyncripQ7TMK9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SyncripQ7TMK9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SyncripQ7TMK9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SyncripQ7TMK9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SyncripQ7TMK9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SyncripQ7TMK9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SyncripQ7TMK9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SyncripQ7TMK9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SyncripQ7TMK9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SyncripQ7TMK9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SyncripQ7TMK9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SyncripQ7TMK9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SyncripQ7TMK9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SyncripQ7TMK9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SyncripQ7TMK9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SyncripQ7TMK9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SyncripQ7TMK9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SyncripQ7TMK9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SyncripQ7TMK9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SyncripQ7TMK9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SyncripQ7TMK9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SyncripQ7TMK9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SyncripQ7TMK9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SyncripQ7TMK9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SyncripQ7TMK9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SyncripQ7TMK9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SyncripQ7TMK9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SyncripQ7TMK9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SyncripQ7TMK9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SyncripQ7TMK9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SyncripQ7TMK9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SyncripQ7TMK9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SyncripQ7TMK9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SyncripQ7TMK9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SyncripQ7TMK9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SyncripQ7TMK9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SyncripQ7TMK9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SyncripQ7TMK9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
SyncripQ7TMK9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SyncripQ7TMK9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SyncripQ7TMK9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms