Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Higd1cQ76I25 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Higd1cQ76I25 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Higd1cQ76I25 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Higd1cQ76I25 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Higd1cQ76I25 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Higd1cQ76I25 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Higd1cQ76I25 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Higd1cQ76I25 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Higd1cQ76I25 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Higd1cQ76I25 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Higd1cQ76I25 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Higd1cQ76I25 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Higd1cQ76I25 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Higd1cQ76I25 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Higd1cQ76I25 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Higd1cQ76I25 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Higd1cQ76I25 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Higd1cQ76I25 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Higd1cQ76I25 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Higd1cQ76I25 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Higd1cQ76I25 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Higd1cQ76I25 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Higd1cQ76I25 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Higd1cQ76I25 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Higd1cQ76I25 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Higd1cQ76I25 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Higd1cQ76I25 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Higd1cQ76I25 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Higd1cQ76I25 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Higd1cQ76I25 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Higd1cQ76I25 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Higd1cQ76I25 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Higd1cQ76I25 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Higd1cQ76I25 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Higd1cQ76I25 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Higd1cQ76I25 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Higd1cQ76I25 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Higd1cQ76I25 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Higd1cQ76I25 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Higd1cQ76I25 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Higd1cQ76I25 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Higd1cQ76I25 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Higd1cQ76I25 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Higd1cQ76I25 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Higd1cQ76I25 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Higd1cQ76I25 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Higd1cQ76I25 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Higd1cQ76I25 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Higd1cQ76I25 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Higd1cQ76I25 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Higd1cQ76I25 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Higd1cQ76I25 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Higd1cQ76I25 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Higd1cQ76I25 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Higd1cQ76I25 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Higd1cQ76I25 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Higd1cQ76I25 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Higd1cQ76I25 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Higd1cQ76I25 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Higd1cQ76I25 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Higd1cQ76I25 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Higd1cQ76I25 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Higd1cQ76I25 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Higd1cQ76I25 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Higd1cQ76I25 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Higd1cQ76I25 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Higd1cQ76I25 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Higd1cQ76I25 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Higd1cQ76I25 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Higd1cQ76I25 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Higd1cQ76I25 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Higd1cQ76I25 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Higd1cQ76I25 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Higd1cQ76I25 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Higd1cQ76I25 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Higd1cQ76I25 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Higd1cQ76I25 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Higd1cQ76I25 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Higd1cQ76I25 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Higd1cQ76I25 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Higd1cQ76I25 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Higd1cQ76I25 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Higd1cQ76I25 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Higd1cQ76I25 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Higd1cQ76I25 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Higd1cQ76I25 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Higd1cQ76I25 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Higd1cQ76I25 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Higd1cQ76I25 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Higd1cQ76I25 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Higd1cQ76I25 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Higd1cQ76I25 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Higd1cQ76I25 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Higd1cQ76I25 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Higd1cQ76I25 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Higd1cQ76I25 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Higd1cQ76I25 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Higd1cQ76I25 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Higd1cQ76I25 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms