Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syne2Q6ZWQ0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syne2Q6ZWQ0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syne2Q6ZWQ0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syne2Q6ZWQ0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syne2Q6ZWQ0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syne2Q6ZWQ0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Syne2Q6ZWQ0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Syne2Q6ZWQ0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Syne2Q6ZWQ0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Syne2Q6ZWQ0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Syne2Q6ZWQ0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Syne2Q6ZWQ0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syne2Q6ZWQ0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syne2Q6ZWQ0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syne2Q6ZWQ0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syne2Q6ZWQ0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Syne2Q6ZWQ0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Syne2Q6ZWQ0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Syne2Q6ZWQ0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Syne2Q6ZWQ0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Syne2Q6ZWQ0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Syne2Q6ZWQ0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Syne2Q6ZWQ0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Syne2Q6ZWQ0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Syne2Q6ZWQ0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Syne2Q6ZWQ0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Syne2Q6ZWQ0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Syne2Q6ZWQ0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Syne2Q6ZWQ0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Syne2Q6ZWQ0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Syne2Q6ZWQ0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Syne2Q6ZWQ0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Syne2Q6ZWQ0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Syne2Q6ZWQ0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Syne2Q6ZWQ0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Syne2Q6ZWQ0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Syne2Q6ZWQ0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Syne2Q6ZWQ0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Syne2Q6ZWQ0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Syne2Q6ZWQ0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Syne2Q6ZWQ0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Syne2Q6ZWQ0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Syne2Q6ZWQ0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Syne2Q6ZWQ0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Syne2Q6ZWQ0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Syne2Q6ZWQ0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Syne2Q6ZWQ0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syne2Q6ZWQ0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syne2Q6ZWQ0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Syne2Q6ZWQ0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syne2Q6ZWQ0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syne2Q6ZWQ0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syne2Q6ZWQ0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syne2Q6ZWQ0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Syne2Q6ZWQ0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Syne2Q6ZWQ0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Syne2Q6ZWQ0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Syne2Q6ZWQ0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Syne2Q6ZWQ0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Syne2Q6ZWQ0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Syne2Q6ZWQ0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Syne2Q6ZWQ0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Syne2Q6ZWQ0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Syne2Q6ZWQ0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Syne2Q6ZWQ0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Syne2Q6ZWQ0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Syne2Q6ZWQ0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Syne2Q6ZWQ0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Syne2Q6ZWQ0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Syne2Q6ZWQ0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Syne2Q6ZWQ0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Syne2Q6ZWQ0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Syne2Q6ZWQ0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Syne2Q6ZWQ0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Syne2Q6ZWQ0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Syne2Q6ZWQ0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Syne2Q6ZWQ0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Syne2Q6ZWQ0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Syne2Q6ZWQ0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Syne2Q6ZWQ0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Syne2Q6ZWQ0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Syne2Q6ZWQ0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Syne2Q6ZWQ0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Syne2Q6ZWQ0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Syne2Q6ZWQ0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Syne2Q6ZWQ0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Syne2Q6ZWQ0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Syne2Q6ZWQ0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Syne2Q6ZWQ0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Syne2Q6ZWQ0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Syne2Q6ZWQ0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Syne2Q6ZWQ0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Syne2Q6ZWQ0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Syne2Q6ZWQ0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Syne2Q6ZWQ0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Syne2Q6ZWQ0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Syne2Q6ZWQ0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Syne2Q6ZWQ0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Syne2Q6ZWQ0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms