Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE13

Prrt3, Proline-rich transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt3Q6PE13 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Prrt3Q6PE13 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Prrt3Q6PE13 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Prrt3Q6PE13 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Prrt3Q6PE13 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Prrt3Q6PE13 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Prrt3Q6PE13 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Prrt3Q6PE13 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Prrt3Q6PE13 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Prrt3Q6PE13 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prrt3Q6PE13 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prrt3Q6PE13 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Prrt3Q6PE13 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Prrt3Q6PE13 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Prrt3Q6PE13 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Prrt3Q6PE13 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prrt3Q6PE13 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prrt3Q6PE13 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prrt3Q6PE13 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Prrt3Q6PE13 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Prrt3Q6PE13 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prrt3Q6PE13 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prrt3Q6PE13 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Prrt3Q6PE13 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Prrt3Q6PE13 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Prrt3Q6PE13 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Prrt3Q6PE13 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Prrt3Q6PE13 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Prrt3Q6PE13 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Prrt3Q6PE13 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Prrt3Q6PE13 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Prrt3Q6PE13 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Prrt3Q6PE13 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Prrt3Q6PE13 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Prrt3Q6PE13 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Prrt3Q6PE13 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Prrt3Q6PE13 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Prrt3Q6PE13 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Prrt3Q6PE13 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Prrt3Q6PE13 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Prrt3Q6PE13 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Prrt3Q6PE13 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Prrt3Q6PE13 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Prrt3Q6PE13 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Prrt3Q6PE13 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Prrt3Q6PE13 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Prrt3Q6PE13 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Prrt3Q6PE13 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Prrt3Q6PE13 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Prrt3Q6PE13 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Prrt3Q6PE13 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Prrt3Q6PE13 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Prrt3Q6PE13 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Prrt3Q6PE13 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Prrt3Q6PE13 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Prrt3Q6PE13 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Prrt3Q6PE13 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Prrt3Q6PE13 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Prrt3Q6PE13 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Prrt3Q6PE13 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prrt3Q6PE13 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prrt3Q6PE13 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prrt3Q6PE13 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prrt3Q6PE13 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Prrt3Q6PE13 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prrt3Q6PE13 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prrt3Q6PE13 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Prrt3Q6PE13 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Prrt3Q6PE13 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Prrt3Q6PE13 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Prrt3Q6PE13 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prrt3Q6PE13 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prrt3Q6PE13 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prrt3Q6PE13 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prrt3Q6PE13 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prrt3Q6PE13 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prrt3Q6PE13 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prrt3Q6PE13 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prrt3Q6PE13 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prrt3Q6PE13 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prrt3Q6PE13 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prrt3Q6PE13 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prrt3Q6PE13 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prrt3Q6PE13 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Prrt3Q6PE13 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Prrt3Q6PE13 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Prrt3Q6PE13 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Prrt3Q6PE13 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prrt3Q6PE13 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prrt3Q6PE13 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prrt3Q6PE13 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prrt3Q6PE13 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Prrt3Q6PE13 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Prrt3Q6PE13 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Prrt3Q6PE13 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prrt3Q6PE13 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prrt3Q6PE13 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Prrt3Q6PE13 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Prrt3Q6PE13 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Prrt3Q6PE13 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms