Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDM4

Ccdc36, Interactor of HORMAD1 protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc36Q6PDM4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc36Q6PDM4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc36Q6PDM4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc36Q6PDM4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc36Q6PDM4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc36Q6PDM4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc36Q6PDM4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc36Q6PDM4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc36Q6PDM4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc36Q6PDM4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc36Q6PDM4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc36Q6PDM4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc36Q6PDM4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc36Q6PDM4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc36Q6PDM4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc36Q6PDM4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc36Q6PDM4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc36Q6PDM4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc36Q6PDM4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc36Q6PDM4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc36Q6PDM4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc36Q6PDM4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc36Q6PDM4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc36Q6PDM4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc36Q6PDM4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc36Q6PDM4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc36Q6PDM4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc36Q6PDM4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc36Q6PDM4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc36Q6PDM4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc36Q6PDM4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc36Q6PDM4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc36Q6PDM4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc36Q6PDM4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc36Q6PDM4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc36Q6PDM4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc36Q6PDM4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc36Q6PDM4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc36Q6PDM4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc36Q6PDM4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc36Q6PDM4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc36Q6PDM4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc36Q6PDM4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc36Q6PDM4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc36Q6PDM4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc36Q6PDM4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc36Q6PDM4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc36Q6PDM4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc36Q6PDM4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc36Q6PDM4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc36Q6PDM4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc36Q6PDM4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc36Q6PDM4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc36Q6PDM4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc36Q6PDM4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc36Q6PDM4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc36Q6PDM4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc36Q6PDM4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc36Q6PDM4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc36Q6PDM4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc36Q6PDM4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc36Q6PDM4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc36Q6PDM4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc36Q6PDM4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc36Q6PDM4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc36Q6PDM4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc36Q6PDM4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc36Q6PDM4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc36Q6PDM4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc36Q6PDM4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc36Q6PDM4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc36Q6PDM4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc36Q6PDM4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc36Q6PDM4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc36Q6PDM4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc36Q6PDM4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc36Q6PDM4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc36Q6PDM4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc36Q6PDM4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc36Q6PDM4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc36Q6PDM4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc36Q6PDM4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc36Q6PDM4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc36Q6PDM4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc36Q6PDM4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc36Q6PDM4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc36Q6PDM4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc36Q6PDM4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc36Q6PDM4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc36Q6PDM4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc36Q6PDM4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc36Q6PDM4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc36Q6PDM4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc36Q6PDM4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc36Q6PDM4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc36Q6PDM4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc36Q6PDM4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc36Q6PDM4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc36Q6PDM4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc36Q6PDM4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.3 ms