Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2L6

Nsd3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsd3Q6P2L6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Nsd3Q6P2L6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.85
Nsd3Q6P2L6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Nsd3Q6P2L6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Nsd3Q6P2L6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Nsd3Q6P2L6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Nsd3Q6P2L6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Nsd3Q6P2L6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Nsd3Q6P2L6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Nsd3Q6P2L6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Nsd3Q6P2L6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Nsd3Q6P2L6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Nsd3Q6P2L6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Nsd3Q6P2L6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Nsd3Q6P2L6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Nsd3Q6P2L6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Nsd3Q6P2L6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
Nsd3Q6P2L6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
Nsd3Q6P2L6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Nsd3Q6P2L6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Nsd3Q6P2L6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Nsd3Q6P2L6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Nsd3Q6P2L6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Nsd3Q6P2L6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Nsd3Q6P2L6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Nsd3Q6P2L6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Nsd3Q6P2L6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Nsd3Q6P2L6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Nsd3Q6P2L6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Nsd3Q6P2L6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Nsd3Q6P2L6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Nsd3Q6P2L6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Nsd3Q6P2L6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Nsd3Q6P2L6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Nsd3Q6P2L6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
Nsd3Q6P2L6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Nsd3Q6P2L6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Nsd3Q6P2L6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Nsd3Q6P2L6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Nsd3Q6P2L6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Nsd3Q6P2L6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Nsd3Q6P2L6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Nsd3Q6P2L6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Nsd3Q6P2L6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Nsd3Q6P2L6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Nsd3Q6P2L6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Nsd3Q6P2L6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Nsd3Q6P2L6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Nsd3Q6P2L6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Nsd3Q6P2L6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Nsd3Q6P2L6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Nsd3Q6P2L6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Nsd3Q6P2L6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Nsd3Q6P2L6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Nsd3Q6P2L6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Nsd3Q6P2L6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Nsd3Q6P2L6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Nsd3Q6P2L6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Nsd3Q6P2L6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Nsd3Q6P2L6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Nsd3Q6P2L6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
Nsd3Q6P2L6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Nsd3Q6P2L6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Nsd3Q6P2L6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Nsd3Q6P2L6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Nsd3Q6P2L6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Nsd3Q6P2L6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Nsd3Q6P2L6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Nsd3Q6P2L6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Nsd3Q6P2L6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
Nsd3Q6P2L6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Nsd3Q6P2L6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Nsd3Q6P2L6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Nsd3Q6P2L6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
Nsd3Q6P2L6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Nsd3Q6P2L6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Nsd3Q6P2L6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Nsd3Q6P2L6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Nsd3Q6P2L6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Nsd3Q6P2L6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Nsd3Q6P2L6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Nsd3Q6P2L6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Nsd3Q6P2L6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Nsd3Q6P2L6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Nsd3Q6P2L6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Nsd3Q6P2L6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Nsd3Q6P2L6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Nsd3Q6P2L6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
Nsd3Q6P2L6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Nsd3Q6P2L6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Nsd3Q6P2L6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Nsd3Q6P2L6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.77
Nsd3Q6P2L6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Nsd3Q6P2L6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Nsd3Q6P2L6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Nsd3Q6P2L6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Nsd3Q6P2L6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Nsd3Q6P2L6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Nsd3Q6P2L6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Nsd3Q6P2L6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms