Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZR5

Skiv2l, Superkiller viralicidic activity 2-like (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skiv2lQ6NZR5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Skiv2lQ6NZR5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Skiv2lQ6NZR5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Skiv2lQ6NZR5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Skiv2lQ6NZR5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Skiv2lQ6NZR5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Skiv2lQ6NZR5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Skiv2lQ6NZR5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Skiv2lQ6NZR5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Skiv2lQ6NZR5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Skiv2lQ6NZR5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Skiv2lQ6NZR5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Skiv2lQ6NZR5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Skiv2lQ6NZR5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Skiv2lQ6NZR5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Skiv2lQ6NZR5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Skiv2lQ6NZR5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Skiv2lQ6NZR5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Skiv2lQ6NZR5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Skiv2lQ6NZR5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Skiv2lQ6NZR5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Skiv2lQ6NZR5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Skiv2lQ6NZR5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Skiv2lQ6NZR5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Skiv2lQ6NZR5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Skiv2lQ6NZR5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Skiv2lQ6NZR5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Skiv2lQ6NZR5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Skiv2lQ6NZR5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Skiv2lQ6NZR5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Skiv2lQ6NZR5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Skiv2lQ6NZR5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Skiv2lQ6NZR5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Skiv2lQ6NZR5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Skiv2lQ6NZR5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Skiv2lQ6NZR5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Skiv2lQ6NZR5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Skiv2lQ6NZR5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Skiv2lQ6NZR5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Skiv2lQ6NZR5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Skiv2lQ6NZR5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Skiv2lQ6NZR5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Skiv2lQ6NZR5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Skiv2lQ6NZR5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Skiv2lQ6NZR5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Skiv2lQ6NZR5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Skiv2lQ6NZR5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Skiv2lQ6NZR5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Skiv2lQ6NZR5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Skiv2lQ6NZR5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Skiv2lQ6NZR5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Skiv2lQ6NZR5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.56■■■□□ 2
Skiv2lQ6NZR5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Skiv2lQ6NZR5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Skiv2lQ6NZR5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Skiv2lQ6NZR5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Skiv2lQ6NZR5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Skiv2lQ6NZR5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Skiv2lQ6NZR5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Skiv2lQ6NZR5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Skiv2lQ6NZR5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Skiv2lQ6NZR5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Skiv2lQ6NZR5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Skiv2lQ6NZR5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Skiv2lQ6NZR5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Skiv2lQ6NZR5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Skiv2lQ6NZR5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Skiv2lQ6NZR5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Skiv2lQ6NZR5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Skiv2lQ6NZR5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Skiv2lQ6NZR5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Skiv2lQ6NZR5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Skiv2lQ6NZR5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Skiv2lQ6NZR5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Skiv2lQ6NZR5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Skiv2lQ6NZR5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Skiv2lQ6NZR5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Skiv2lQ6NZR5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Skiv2lQ6NZR5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Skiv2lQ6NZR5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Skiv2lQ6NZR5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Skiv2lQ6NZR5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Skiv2lQ6NZR5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Skiv2lQ6NZR5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Skiv2lQ6NZR5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Skiv2lQ6NZR5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Skiv2lQ6NZR5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Skiv2lQ6NZR5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Skiv2lQ6NZR5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Skiv2lQ6NZR5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Skiv2lQ6NZR5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Skiv2lQ6NZR5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Skiv2lQ6NZR5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Skiv2lQ6NZR5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Skiv2lQ6NZR5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Skiv2lQ6NZR5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Skiv2lQ6NZR5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Skiv2lQ6NZR5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Skiv2lQ6NZR5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Skiv2lQ6NZR5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms