Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVE3

Spin2c, Spindlin-2C, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spin2cQ6NVE3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Spin2cQ6NVE3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Spin2cQ6NVE3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Spin2cQ6NVE3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Spin2cQ6NVE3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Spin2cQ6NVE3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Spin2cQ6NVE3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Spin2cQ6NVE3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Spin2cQ6NVE3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Spin2cQ6NVE3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Spin2cQ6NVE3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Spin2cQ6NVE3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Spin2cQ6NVE3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Spin2cQ6NVE3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Spin2cQ6NVE3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Spin2cQ6NVE3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Spin2cQ6NVE3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Spin2cQ6NVE3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Spin2cQ6NVE3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Spin2cQ6NVE3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Spin2cQ6NVE3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Spin2cQ6NVE3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Spin2cQ6NVE3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Spin2cQ6NVE3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Spin2cQ6NVE3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Spin2cQ6NVE3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Spin2cQ6NVE3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Spin2cQ6NVE3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Spin2cQ6NVE3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Spin2cQ6NVE3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Spin2cQ6NVE3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Spin2cQ6NVE3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Spin2cQ6NVE3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Spin2cQ6NVE3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Spin2cQ6NVE3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Spin2cQ6NVE3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Spin2cQ6NVE3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Spin2cQ6NVE3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Spin2cQ6NVE3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Spin2cQ6NVE3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Spin2cQ6NVE3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Spin2cQ6NVE3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Spin2cQ6NVE3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Spin2cQ6NVE3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Spin2cQ6NVE3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Spin2cQ6NVE3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Spin2cQ6NVE3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Spin2cQ6NVE3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Spin2cQ6NVE3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Spin2cQ6NVE3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Spin2cQ6NVE3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Spin2cQ6NVE3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Spin2cQ6NVE3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Spin2cQ6NVE3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Spin2cQ6NVE3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Spin2cQ6NVE3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Spin2cQ6NVE3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Spin2cQ6NVE3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Spin2cQ6NVE3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Spin2cQ6NVE3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Spin2cQ6NVE3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Spin2cQ6NVE3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Spin2cQ6NVE3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Spin2cQ6NVE3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Spin2cQ6NVE3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Spin2cQ6NVE3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Spin2cQ6NVE3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Spin2cQ6NVE3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Spin2cQ6NVE3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Spin2cQ6NVE3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Spin2cQ6NVE3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Spin2cQ6NVE3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Spin2cQ6NVE3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Spin2cQ6NVE3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Spin2cQ6NVE3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Spin2cQ6NVE3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Spin2cQ6NVE3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Spin2cQ6NVE3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Spin2cQ6NVE3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Spin2cQ6NVE3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Spin2cQ6NVE3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Spin2cQ6NVE3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Spin2cQ6NVE3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Spin2cQ6NVE3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Spin2cQ6NVE3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Spin2cQ6NVE3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Spin2cQ6NVE3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Spin2cQ6NVE3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Spin2cQ6NVE3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Spin2cQ6NVE3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Spin2cQ6NVE3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Spin2cQ6NVE3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Spin2cQ6NVE3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Spin2cQ6NVE3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Spin2cQ6NVE3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Spin2cQ6NVE3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Spin2cQ6NVE3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Spin2cQ6NVE3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Spin2cQ6NVE3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Spin2cQ6NVE3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms