Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atg16l2Q6KAU8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atg16l2Q6KAU8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atg16l2Q6KAU8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atg16l2Q6KAU8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atg16l2Q6KAU8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atg16l2Q6KAU8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atg16l2Q6KAU8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atg16l2Q6KAU8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Atg16l2Q6KAU8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Atg16l2Q6KAU8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atg16l2Q6KAU8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atg16l2Q6KAU8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atg16l2Q6KAU8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atg16l2Q6KAU8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atg16l2Q6KAU8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atg16l2Q6KAU8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atg16l2Q6KAU8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atg16l2Q6KAU8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atg16l2Q6KAU8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atg16l2Q6KAU8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atg16l2Q6KAU8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atg16l2Q6KAU8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atg16l2Q6KAU8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atg16l2Q6KAU8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Atg16l2Q6KAU8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Atg16l2Q6KAU8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atg16l2Q6KAU8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atg16l2Q6KAU8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atg16l2Q6KAU8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atg16l2Q6KAU8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atg16l2Q6KAU8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atg16l2Q6KAU8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atg16l2Q6KAU8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Atg16l2Q6KAU8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atg16l2Q6KAU8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atg16l2Q6KAU8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atg16l2Q6KAU8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atg16l2Q6KAU8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atg16l2Q6KAU8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atg16l2Q6KAU8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atg16l2Q6KAU8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atg16l2Q6KAU8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atg16l2Q6KAU8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atg16l2Q6KAU8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atg16l2Q6KAU8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Atg16l2Q6KAU8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atg16l2Q6KAU8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atg16l2Q6KAU8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atg16l2Q6KAU8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atg16l2Q6KAU8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atg16l2Q6KAU8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atg16l2Q6KAU8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atg16l2Q6KAU8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atg16l2Q6KAU8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atg16l2Q6KAU8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atg16l2Q6KAU8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atg16l2Q6KAU8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Atg16l2Q6KAU8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atg16l2Q6KAU8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atg16l2Q6KAU8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atg16l2Q6KAU8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atg16l2Q6KAU8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Atg16l2Q6KAU8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atg16l2Q6KAU8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atg16l2Q6KAU8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atg16l2Q6KAU8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atg16l2Q6KAU8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atg16l2Q6KAU8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atg16l2Q6KAU8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atg16l2Q6KAU8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atg16l2Q6KAU8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atg16l2Q6KAU8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Atg16l2Q6KAU8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atg16l2Q6KAU8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atg16l2Q6KAU8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atg16l2Q6KAU8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atg16l2Q6KAU8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atg16l2Q6KAU8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atg16l2Q6KAU8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atg16l2Q6KAU8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atg16l2Q6KAU8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atg16l2Q6KAU8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atg16l2Q6KAU8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atg16l2Q6KAU8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atg16l2Q6KAU8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atg16l2Q6KAU8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atg16l2Q6KAU8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atg16l2Q6KAU8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Atg16l2Q6KAU8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atg16l2Q6KAU8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Atg16l2Q6KAU8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atg16l2Q6KAU8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atg16l2Q6KAU8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atg16l2Q6KAU8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atg16l2Q6KAU8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atg16l2Q6KAU8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atg16l2Q6KAU8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atg16l2Q6KAU8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atg16l2Q6KAU8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 162.8 ms