Protein–RNA interactions for Protein: Q6K1E7

Ggnbp1, Gametogenetin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggnbp1Q6K1E7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ggnbp1Q6K1E7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ggnbp1Q6K1E7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Ggnbp1Q6K1E7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ggnbp1Q6K1E7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ggnbp1Q6K1E7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ggnbp1Q6K1E7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ggnbp1Q6K1E7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ggnbp1Q6K1E7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ggnbp1Q6K1E7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ggnbp1Q6K1E7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ggnbp1Q6K1E7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ggnbp1Q6K1E7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ggnbp1Q6K1E7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ggnbp1Q6K1E7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ggnbp1Q6K1E7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ggnbp1Q6K1E7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ggnbp1Q6K1E7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ggnbp1Q6K1E7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ggnbp1Q6K1E7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ggnbp1Q6K1E7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ggnbp1Q6K1E7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ggnbp1Q6K1E7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ggnbp1Q6K1E7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ggnbp1Q6K1E7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Ggnbp1Q6K1E7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ggnbp1Q6K1E7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ggnbp1Q6K1E7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ggnbp1Q6K1E7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ggnbp1Q6K1E7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ggnbp1Q6K1E7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ggnbp1Q6K1E7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ggnbp1Q6K1E7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ggnbp1Q6K1E7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ggnbp1Q6K1E7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ggnbp1Q6K1E7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ggnbp1Q6K1E7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Ggnbp1Q6K1E7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ggnbp1Q6K1E7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ggnbp1Q6K1E7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ggnbp1Q6K1E7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ggnbp1Q6K1E7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ggnbp1Q6K1E7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Ggnbp1Q6K1E7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ggnbp1Q6K1E7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ggnbp1Q6K1E7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ggnbp1Q6K1E7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ggnbp1Q6K1E7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ggnbp1Q6K1E7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ggnbp1Q6K1E7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ggnbp1Q6K1E7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ggnbp1Q6K1E7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ggnbp1Q6K1E7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ggnbp1Q6K1E7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ggnbp1Q6K1E7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ggnbp1Q6K1E7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ggnbp1Q6K1E7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ggnbp1Q6K1E7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ggnbp1Q6K1E7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ggnbp1Q6K1E7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ggnbp1Q6K1E7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ggnbp1Q6K1E7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ggnbp1Q6K1E7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ggnbp1Q6K1E7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ggnbp1Q6K1E7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ggnbp1Q6K1E7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ggnbp1Q6K1E7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Ggnbp1Q6K1E7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ggnbp1Q6K1E7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ggnbp1Q6K1E7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ggnbp1Q6K1E7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ggnbp1Q6K1E7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ggnbp1Q6K1E7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ggnbp1Q6K1E7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ggnbp1Q6K1E7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ggnbp1Q6K1E7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ggnbp1Q6K1E7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ggnbp1Q6K1E7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ggnbp1Q6K1E7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ggnbp1Q6K1E7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ggnbp1Q6K1E7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ggnbp1Q6K1E7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ggnbp1Q6K1E7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ggnbp1Q6K1E7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ggnbp1Q6K1E7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ggnbp1Q6K1E7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ggnbp1Q6K1E7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Ggnbp1Q6K1E7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ggnbp1Q6K1E7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ggnbp1Q6K1E7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Ggnbp1Q6K1E7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ggnbp1Q6K1E7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ggnbp1Q6K1E7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ggnbp1Q6K1E7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ggnbp1Q6K1E7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ggnbp1Q6K1E7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ggnbp1Q6K1E7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ggnbp1Q6K1E7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ggnbp1Q6K1E7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ggnbp1Q6K1E7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms