Protein–RNA interactions for Protein: Q6JPI3

Med13l, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13-like, mousemouse

Predictions only

Length 2,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13lQ6JPI3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Med13lQ6JPI3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Med13lQ6JPI3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Med13lQ6JPI3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Med13lQ6JPI3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Med13lQ6JPI3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Med13lQ6JPI3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Med13lQ6JPI3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Med13lQ6JPI3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Med13lQ6JPI3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Med13lQ6JPI3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Med13lQ6JPI3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Med13lQ6JPI3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Med13lQ6JPI3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Med13lQ6JPI3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Med13lQ6JPI3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Med13lQ6JPI3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Med13lQ6JPI3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Med13lQ6JPI3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Med13lQ6JPI3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Med13lQ6JPI3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Med13lQ6JPI3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Med13lQ6JPI3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Med13lQ6JPI3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Med13lQ6JPI3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Med13lQ6JPI3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Med13lQ6JPI3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Med13lQ6JPI3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Med13lQ6JPI3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Med13lQ6JPI3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Med13lQ6JPI3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Med13lQ6JPI3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Med13lQ6JPI3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Med13lQ6JPI3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Med13lQ6JPI3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Med13lQ6JPI3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Med13lQ6JPI3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Med13lQ6JPI3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Med13lQ6JPI3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Med13lQ6JPI3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Med13lQ6JPI3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Med13lQ6JPI3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Med13lQ6JPI3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Med13lQ6JPI3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Med13lQ6JPI3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Med13lQ6JPI3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Med13lQ6JPI3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Med13lQ6JPI3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Med13lQ6JPI3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Med13lQ6JPI3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Med13lQ6JPI3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Med13lQ6JPI3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Med13lQ6JPI3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Med13lQ6JPI3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Med13lQ6JPI3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Med13lQ6JPI3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Med13lQ6JPI3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Med13lQ6JPI3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Med13lQ6JPI3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Med13lQ6JPI3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Med13lQ6JPI3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Med13lQ6JPI3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Med13lQ6JPI3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Med13lQ6JPI3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Med13lQ6JPI3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Med13lQ6JPI3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Med13lQ6JPI3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Med13lQ6JPI3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Med13lQ6JPI3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Med13lQ6JPI3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Med13lQ6JPI3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Med13lQ6JPI3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Med13lQ6JPI3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Med13lQ6JPI3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Med13lQ6JPI3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Med13lQ6JPI3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Med13lQ6JPI3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Med13lQ6JPI3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Med13lQ6JPI3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Med13lQ6JPI3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Med13lQ6JPI3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Med13lQ6JPI3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Med13lQ6JPI3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Med13lQ6JPI3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Med13lQ6JPI3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Med13lQ6JPI3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Med13lQ6JPI3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Med13lQ6JPI3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Med13lQ6JPI3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Med13lQ6JPI3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Med13lQ6JPI3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Med13lQ6JPI3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Med13lQ6JPI3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Med13lQ6JPI3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Med13lQ6JPI3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Med13lQ6JPI3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Med13lQ6JPI3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Med13lQ6JPI3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Med13lQ6JPI3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Med13lQ6JPI3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 434 ms