Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZJ7

Ric1, RAB6A-GEF complex partner protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ric1Q69ZJ7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
Ric1Q69ZJ7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ric1Q69ZJ7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Ric1Q69ZJ7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Ric1Q69ZJ7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Ric1Q69ZJ7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ric1Q69ZJ7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ric1Q69ZJ7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ric1Q69ZJ7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Ric1Q69ZJ7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Ric1Q69ZJ7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Ric1Q69ZJ7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Ric1Q69ZJ7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Ric1Q69ZJ7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Ric1Q69ZJ7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Ric1Q69ZJ7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Ric1Q69ZJ7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Ric1Q69ZJ7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Ric1Q69ZJ7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Ric1Q69ZJ7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
Ric1Q69ZJ7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
Ric1Q69ZJ7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Ric1Q69ZJ7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Ric1Q69ZJ7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Ric1Q69ZJ7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Ric1Q69ZJ7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Ric1Q69ZJ7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Ric1Q69ZJ7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Ric1Q69ZJ7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Ric1Q69ZJ7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Ric1Q69ZJ7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Ric1Q69ZJ7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
Ric1Q69ZJ7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Ric1Q69ZJ7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Ric1Q69ZJ7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Ric1Q69ZJ7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Ric1Q69ZJ7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Ric1Q69ZJ7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Ric1Q69ZJ7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Ric1Q69ZJ7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Ric1Q69ZJ7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Ric1Q69ZJ7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Ric1Q69ZJ7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Ric1Q69ZJ7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
Ric1Q69ZJ7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Ric1Q69ZJ7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Ric1Q69ZJ7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Ric1Q69ZJ7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Ric1Q69ZJ7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Ric1Q69ZJ7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Ric1Q69ZJ7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Ric1Q69ZJ7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Ric1Q69ZJ7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Ric1Q69ZJ7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Ric1Q69ZJ7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Ric1Q69ZJ7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Ric1Q69ZJ7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Ric1Q69ZJ7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
Ric1Q69ZJ7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Ric1Q69ZJ7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Ric1Q69ZJ7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Ric1Q69ZJ7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Ric1Q69ZJ7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Ric1Q69ZJ7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Ric1Q69ZJ7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Ric1Q69ZJ7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Ric1Q69ZJ7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Ric1Q69ZJ7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Ric1Q69ZJ7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Ric1Q69ZJ7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Ric1Q69ZJ7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Ric1Q69ZJ7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Ric1Q69ZJ7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Ric1Q69ZJ7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Ric1Q69ZJ7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
Ric1Q69ZJ7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Ric1Q69ZJ7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
Ric1Q69ZJ7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Ric1Q69ZJ7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Ric1Q69ZJ7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Ric1Q69ZJ7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Ric1Q69ZJ7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Ric1Q69ZJ7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Ric1Q69ZJ7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Ric1Q69ZJ7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Ric1Q69ZJ7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Ric1Q69ZJ7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Ric1Q69ZJ7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Ric1Q69ZJ7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Ric1Q69ZJ7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Ric1Q69ZJ7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Ric1Q69ZJ7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Ric1Q69ZJ7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Ric1Q69ZJ7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Ric1Q69ZJ7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Ric1Q69ZJ7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Ric1Q69ZJ7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Ric1Q69ZJ7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Ric1Q69ZJ7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Ric1Q69ZJ7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms