Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD9

Kiaa1549, UPF0606 protein KIAA1549, mousemouse

Predictions only

Length 1,940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kiaa1549Q68FD9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kiaa1549Q68FD9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kiaa1549Q68FD9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kiaa1549Q68FD9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kiaa1549Q68FD9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kiaa1549Q68FD9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kiaa1549Q68FD9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kiaa1549Q68FD9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Kiaa1549Q68FD9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kiaa1549Q68FD9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kiaa1549Q68FD9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kiaa1549Q68FD9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kiaa1549Q68FD9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kiaa1549Q68FD9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kiaa1549Q68FD9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kiaa1549Q68FD9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kiaa1549Q68FD9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kiaa1549Q68FD9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kiaa1549Q68FD9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kiaa1549Q68FD9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kiaa1549Q68FD9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kiaa1549Q68FD9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kiaa1549Q68FD9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kiaa1549Q68FD9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kiaa1549Q68FD9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kiaa1549Q68FD9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kiaa1549Q68FD9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kiaa1549Q68FD9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Kiaa1549Q68FD9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kiaa1549Q68FD9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Kiaa1549Q68FD9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Kiaa1549Q68FD9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kiaa1549Q68FD9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kiaa1549Q68FD9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kiaa1549Q68FD9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kiaa1549Q68FD9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kiaa1549Q68FD9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kiaa1549Q68FD9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kiaa1549Q68FD9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kiaa1549Q68FD9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kiaa1549Q68FD9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kiaa1549Q68FD9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kiaa1549Q68FD9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kiaa1549Q68FD9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kiaa1549Q68FD9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kiaa1549Q68FD9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Kiaa1549Q68FD9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kiaa1549Q68FD9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kiaa1549Q68FD9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kiaa1549Q68FD9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kiaa1549Q68FD9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kiaa1549Q68FD9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kiaa1549Q68FD9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kiaa1549Q68FD9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kiaa1549Q68FD9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kiaa1549Q68FD9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kiaa1549Q68FD9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kiaa1549Q68FD9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kiaa1549Q68FD9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kiaa1549Q68FD9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kiaa1549Q68FD9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kiaa1549Q68FD9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kiaa1549Q68FD9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kiaa1549Q68FD9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kiaa1549Q68FD9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Kiaa1549Q68FD9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kiaa1549Q68FD9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kiaa1549Q68FD9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kiaa1549Q68FD9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kiaa1549Q68FD9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kiaa1549Q68FD9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kiaa1549Q68FD9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kiaa1549Q68FD9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kiaa1549Q68FD9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kiaa1549Q68FD9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kiaa1549Q68FD9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kiaa1549Q68FD9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kiaa1549Q68FD9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kiaa1549Q68FD9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Kiaa1549Q68FD9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kiaa1549Q68FD9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kiaa1549Q68FD9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kiaa1549Q68FD9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kiaa1549Q68FD9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kiaa1549Q68FD9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kiaa1549Q68FD9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kiaa1549Q68FD9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Kiaa1549Q68FD9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kiaa1549Q68FD9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kiaa1549Q68FD9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kiaa1549Q68FD9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kiaa1549Q68FD9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Kiaa1549Q68FD9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kiaa1549Q68FD9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kiaa1549Q68FD9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kiaa1549Q68FD9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kiaa1549Q68FD9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kiaa1549Q68FD9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kiaa1549Q68FD9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kiaa1549Q68FD9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms