Protein–RNA interactions for Protein: Q64697

Ptprcap, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprcapQ64697 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PtprcapQ64697 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PtprcapQ64697 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PtprcapQ64697 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PtprcapQ64697 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PtprcapQ64697 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PtprcapQ64697 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PtprcapQ64697 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PtprcapQ64697 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PtprcapQ64697 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PtprcapQ64697 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PtprcapQ64697 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PtprcapQ64697 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PtprcapQ64697 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PtprcapQ64697 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PtprcapQ64697 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PtprcapQ64697 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PtprcapQ64697 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PtprcapQ64697 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PtprcapQ64697 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PtprcapQ64697 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PtprcapQ64697 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PtprcapQ64697 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PtprcapQ64697 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PtprcapQ64697 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PtprcapQ64697 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PtprcapQ64697 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PtprcapQ64697 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PtprcapQ64697 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PtprcapQ64697 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PtprcapQ64697 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PtprcapQ64697 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PtprcapQ64697 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PtprcapQ64697 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PtprcapQ64697 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PtprcapQ64697 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PtprcapQ64697 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PtprcapQ64697 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PtprcapQ64697 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PtprcapQ64697 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PtprcapQ64697 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PtprcapQ64697 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PtprcapQ64697 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PtprcapQ64697 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PtprcapQ64697 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PtprcapQ64697 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PtprcapQ64697 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PtprcapQ64697 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PtprcapQ64697 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PtprcapQ64697 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PtprcapQ64697 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PtprcapQ64697 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PtprcapQ64697 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PtprcapQ64697 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PtprcapQ64697 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PtprcapQ64697 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PtprcapQ64697 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PtprcapQ64697 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PtprcapQ64697 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PtprcapQ64697 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PtprcapQ64697 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PtprcapQ64697 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PtprcapQ64697 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PtprcapQ64697 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PtprcapQ64697 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PtprcapQ64697 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PtprcapQ64697 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PtprcapQ64697 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PtprcapQ64697 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PtprcapQ64697 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PtprcapQ64697 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PtprcapQ64697 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PtprcapQ64697 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PtprcapQ64697 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PtprcapQ64697 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PtprcapQ64697 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PtprcapQ64697 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PtprcapQ64697 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PtprcapQ64697 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PtprcapQ64697 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PtprcapQ64697 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PtprcapQ64697 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PtprcapQ64697 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PtprcapQ64697 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PtprcapQ64697 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PtprcapQ64697 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PtprcapQ64697 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PtprcapQ64697 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PtprcapQ64697 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PtprcapQ64697 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PtprcapQ64697 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PtprcapQ64697 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PtprcapQ64697 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PtprcapQ64697 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PtprcapQ64697 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PtprcapQ64697 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PtprcapQ64697 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PtprcapQ64697 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PtprcapQ64697 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PtprcapQ64697 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 274.4 ms