Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

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Length 837 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pan3Q640Q5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pan3Q640Q5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pan3Q640Q5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pan3Q640Q5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pan3Q640Q5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pan3Q640Q5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pan3Q640Q5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pan3Q640Q5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pan3Q640Q5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pan3Q640Q5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pan3Q640Q5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pan3Q640Q5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pan3Q640Q5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pan3Q640Q5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pan3Q640Q5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pan3Q640Q5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pan3Q640Q5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pan3Q640Q5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pan3Q640Q5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pan3Q640Q5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Pan3Q640Q5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pan3Q640Q5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pan3Q640Q5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pan3Q640Q5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pan3Q640Q5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pan3Q640Q5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pan3Q640Q5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pan3Q640Q5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pan3Q640Q5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pan3Q640Q5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pan3Q640Q5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pan3Q640Q5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pan3Q640Q5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pan3Q640Q5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pan3Q640Q5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pan3Q640Q5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pan3Q640Q5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pan3Q640Q5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pan3Q640Q5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pan3Q640Q5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pan3Q640Q5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pan3Q640Q5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pan3Q640Q5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pan3Q640Q5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pan3Q640Q5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pan3Q640Q5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pan3Q640Q5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pan3Q640Q5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pan3Q640Q5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pan3Q640Q5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pan3Q640Q5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pan3Q640Q5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pan3Q640Q5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pan3Q640Q5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pan3Q640Q5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pan3Q640Q5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pan3Q640Q5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pan3Q640Q5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pan3Q640Q5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pan3Q640Q5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pan3Q640Q5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pan3Q640Q5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pan3Q640Q5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pan3Q640Q5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pan3Q640Q5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Pan3Q640Q5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pan3Q640Q5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pan3Q640Q5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pan3Q640Q5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pan3Q640Q5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pan3Q640Q5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pan3Q640Q5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pan3Q640Q5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pan3Q640Q5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pan3Q640Q5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pan3Q640Q5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pan3Q640Q5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pan3Q640Q5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pan3Q640Q5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pan3Q640Q5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pan3Q640Q5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pan3Q640Q5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pan3Q640Q5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pan3Q640Q5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pan3Q640Q5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pan3Q640Q5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pan3Q640Q5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pan3Q640Q5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pan3Q640Q5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pan3Q640Q5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pan3Q640Q5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pan3Q640Q5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pan3Q640Q5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pan3Q640Q5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pan3Q640Q5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pan3Q640Q5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pan3Q640Q5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pan3Q640Q5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pan3Q640Q5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms