Protein–RNA interactions for Protein: Q62513

Znf260, Zinc finger protein 260, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf260Q62513 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf260Q62513 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf260Q62513 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf260Q62513 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf260Q62513 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf260Q62513 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf260Q62513 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf260Q62513 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf260Q62513 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf260Q62513 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Znf260Q62513 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf260Q62513 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf260Q62513 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf260Q62513 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf260Q62513 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf260Q62513 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Znf260Q62513 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Znf260Q62513 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Znf260Q62513 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf260Q62513 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf260Q62513 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf260Q62513 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf260Q62513 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf260Q62513 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf260Q62513 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf260Q62513 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf260Q62513 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf260Q62513 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf260Q62513 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf260Q62513 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf260Q62513 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf260Q62513 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf260Q62513 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf260Q62513 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf260Q62513 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf260Q62513 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf260Q62513 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf260Q62513 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf260Q62513 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf260Q62513 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Znf260Q62513 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Znf260Q62513 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Znf260Q62513 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf260Q62513 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf260Q62513 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf260Q62513 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf260Q62513 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf260Q62513 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Znf260Q62513 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Znf260Q62513 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Znf260Q62513 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Znf260Q62513 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf260Q62513 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf260Q62513 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf260Q62513 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf260Q62513 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf260Q62513 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf260Q62513 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf260Q62513 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Znf260Q62513 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf260Q62513 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf260Q62513 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Znf260Q62513 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Znf260Q62513 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Znf260Q62513 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Znf260Q62513 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf260Q62513 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf260Q62513 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf260Q62513 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf260Q62513 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf260Q62513 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Znf260Q62513 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Znf260Q62513 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Znf260Q62513 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Znf260Q62513 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Znf260Q62513 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Znf260Q62513 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Znf260Q62513 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf260Q62513 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf260Q62513 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf260Q62513 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Znf260Q62513 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Znf260Q62513 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Znf260Q62513 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Znf260Q62513 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Znf260Q62513 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Znf260Q62513 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Znf260Q62513 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Znf260Q62513 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Znf260Q62513 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Znf260Q62513 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Znf260Q62513 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Znf260Q62513 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Znf260Q62513 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Znf260Q62513 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Znf260Q62513 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Znf260Q62513 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Znf260Q62513 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Znf260Q62513 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Znf260Q62513 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
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