Protein–RNA interactions for Protein: Q62177

Sema3b, Semaphorin-3B, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3bQ62177 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sema3bQ62177 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sema3bQ62177 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sema3bQ62177 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sema3bQ62177 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sema3bQ62177 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sema3bQ62177 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sema3bQ62177 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sema3bQ62177 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sema3bQ62177 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sema3bQ62177 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sema3bQ62177 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sema3bQ62177 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sema3bQ62177 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sema3bQ62177 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sema3bQ62177 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Sema3bQ62177 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Sema3bQ62177 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sema3bQ62177 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sema3bQ62177 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sema3bQ62177 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sema3bQ62177 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sema3bQ62177 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sema3bQ62177 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sema3bQ62177 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sema3bQ62177 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sema3bQ62177 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sema3bQ62177 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sema3bQ62177 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sema3bQ62177 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sema3bQ62177 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sema3bQ62177 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sema3bQ62177 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sema3bQ62177 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Sema3bQ62177 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sema3bQ62177 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sema3bQ62177 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sema3bQ62177 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sema3bQ62177 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sema3bQ62177 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sema3bQ62177 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sema3bQ62177 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Sema3bQ62177 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sema3bQ62177 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sema3bQ62177 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sema3bQ62177 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sema3bQ62177 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sema3bQ62177 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sema3bQ62177 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sema3bQ62177 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sema3bQ62177 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sema3bQ62177 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sema3bQ62177 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sema3bQ62177 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sema3bQ62177 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sema3bQ62177 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sema3bQ62177 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sema3bQ62177 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sema3bQ62177 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sema3bQ62177 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sema3bQ62177 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sema3bQ62177 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sema3bQ62177 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sema3bQ62177 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sema3bQ62177 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sema3bQ62177 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Sema3bQ62177 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sema3bQ62177 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Sema3bQ62177 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sema3bQ62177 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sema3bQ62177 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sema3bQ62177 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sema3bQ62177 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sema3bQ62177 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sema3bQ62177 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sema3bQ62177 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sema3bQ62177 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sema3bQ62177 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Sema3bQ62177 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sema3bQ62177 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sema3bQ62177 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sema3bQ62177 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sema3bQ62177 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sema3bQ62177 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sema3bQ62177 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sema3bQ62177 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sema3bQ62177 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sema3bQ62177 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sema3bQ62177 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sema3bQ62177 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sema3bQ62177 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Sema3bQ62177 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sema3bQ62177 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sema3bQ62177 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sema3bQ62177 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sema3bQ62177 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sema3bQ62177 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sema3bQ62177 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sema3bQ62177 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sema3bQ62177 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms