Protein–RNA interactions for Protein: Q62148

Aldh1a2, Retinal dehydrogenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a2Q62148 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Aldh1a2Q62148 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Aldh1a2Q62148 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Aldh1a2Q62148 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Aldh1a2Q62148 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Aldh1a2Q62148 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Aldh1a2Q62148 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Aldh1a2Q62148 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Aldh1a2Q62148 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Aldh1a2Q62148 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Aldh1a2Q62148 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Aldh1a2Q62148 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Aldh1a2Q62148 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Aldh1a2Q62148 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Aldh1a2Q62148 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Aldh1a2Q62148 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Aldh1a2Q62148 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Aldh1a2Q62148 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Aldh1a2Q62148 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Aldh1a2Q62148 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Aldh1a2Q62148 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Aldh1a2Q62148 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Aldh1a2Q62148 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Aldh1a2Q62148 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Aldh1a2Q62148 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Aldh1a2Q62148 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Aldh1a2Q62148 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Aldh1a2Q62148 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Aldh1a2Q62148 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Aldh1a2Q62148 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Aldh1a2Q62148 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Aldh1a2Q62148 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Aldh1a2Q62148 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Aldh1a2Q62148 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Aldh1a2Q62148 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Aldh1a2Q62148 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Aldh1a2Q62148 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Aldh1a2Q62148 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Aldh1a2Q62148 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Aldh1a2Q62148 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Aldh1a2Q62148 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Aldh1a2Q62148 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Aldh1a2Q62148 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Aldh1a2Q62148 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Aldh1a2Q62148 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Aldh1a2Q62148 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Aldh1a2Q62148 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Aldh1a2Q62148 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Aldh1a2Q62148 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Aldh1a2Q62148 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Aldh1a2Q62148 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Aldh1a2Q62148 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Aldh1a2Q62148 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Aldh1a2Q62148 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Aldh1a2Q62148 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Aldh1a2Q62148 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Aldh1a2Q62148 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Aldh1a2Q62148 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Aldh1a2Q62148 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Aldh1a2Q62148 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Aldh1a2Q62148 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Aldh1a2Q62148 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Aldh1a2Q62148 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Aldh1a2Q62148 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Aldh1a2Q62148 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Aldh1a2Q62148 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Aldh1a2Q62148 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Aldh1a2Q62148 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Aldh1a2Q62148 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Aldh1a2Q62148 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Aldh1a2Q62148 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Aldh1a2Q62148 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Aldh1a2Q62148 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Aldh1a2Q62148 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Aldh1a2Q62148 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Aldh1a2Q62148 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Aldh1a2Q62148 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Aldh1a2Q62148 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Aldh1a2Q62148 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Aldh1a2Q62148 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Aldh1a2Q62148 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Aldh1a2Q62148 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Aldh1a2Q62148 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Aldh1a2Q62148 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Aldh1a2Q62148 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Aldh1a2Q62148 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Aldh1a2Q62148 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Aldh1a2Q62148 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Aldh1a2Q62148 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Aldh1a2Q62148 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Aldh1a2Q62148 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Aldh1a2Q62148 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Aldh1a2Q62148 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Aldh1a2Q62148 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Aldh1a2Q62148 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Aldh1a2Q62148 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Aldh1a2Q62148 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Aldh1a2Q62148 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Aldh1a2Q62148 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Aldh1a2Q62148 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms