Protein–RNA interactions for Protein: Q61152

Ptpn18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn18Q61152 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ptpn18Q61152 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ptpn18Q61152 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ptpn18Q61152 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ptpn18Q61152 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ptpn18Q61152 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ptpn18Q61152 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Ptpn18Q61152 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ptpn18Q61152 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ptpn18Q61152 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ptpn18Q61152 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ptpn18Q61152 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ptpn18Q61152 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ptpn18Q61152 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ptpn18Q61152 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ptpn18Q61152 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ptpn18Q61152 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Ptpn18Q61152 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ptpn18Q61152 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ptpn18Q61152 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ptpn18Q61152 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ptpn18Q61152 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ptpn18Q61152 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ptpn18Q61152 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ptpn18Q61152 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ptpn18Q61152 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ptpn18Q61152 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ptpn18Q61152 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ptpn18Q61152 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ptpn18Q61152 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ptpn18Q61152 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ptpn18Q61152 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ptpn18Q61152 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ptpn18Q61152 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ptpn18Q61152 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ptpn18Q61152 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ptpn18Q61152 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ptpn18Q61152 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ptpn18Q61152 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ptpn18Q61152 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ptpn18Q61152 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ptpn18Q61152 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ptpn18Q61152 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ptpn18Q61152 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ptpn18Q61152 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ptpn18Q61152 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ptpn18Q61152 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ptpn18Q61152 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ptpn18Q61152 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ptpn18Q61152 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ptpn18Q61152 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ptpn18Q61152 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ptpn18Q61152 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ptpn18Q61152 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ptpn18Q61152 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ptpn18Q61152 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ptpn18Q61152 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ptpn18Q61152 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ptpn18Q61152 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ptpn18Q61152 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ptpn18Q61152 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ptpn18Q61152 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ptpn18Q61152 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ptpn18Q61152 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ptpn18Q61152 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ptpn18Q61152 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ptpn18Q61152 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ptpn18Q61152 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ptpn18Q61152 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ptpn18Q61152 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ptpn18Q61152 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ptpn18Q61152 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ptpn18Q61152 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ptpn18Q61152 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ptpn18Q61152 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ptpn18Q61152 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ptpn18Q61152 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ptpn18Q61152 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ptpn18Q61152 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ptpn18Q61152 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ptpn18Q61152 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ptpn18Q61152 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ptpn18Q61152 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ptpn18Q61152 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ptpn18Q61152 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ptpn18Q61152 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ptpn18Q61152 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ptpn18Q61152 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ptpn18Q61152 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ptpn18Q61152 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ptpn18Q61152 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Ptpn18Q61152 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ptpn18Q61152 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ptpn18Q61152 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ptpn18Q61152 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ptpn18Q61152 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ptpn18Q61152 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Ptpn18Q61152 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ptpn18Q61152 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ptpn18Q61152 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms