Protein–RNA interactions for Protein: Q60519

Sema5b, Semaphorin-5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5bQ60519 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sema5bQ60519 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sema5bQ60519 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sema5bQ60519 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sema5bQ60519 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sema5bQ60519 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sema5bQ60519 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sema5bQ60519 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Sema5bQ60519 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sema5bQ60519 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sema5bQ60519 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sema5bQ60519 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sema5bQ60519 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sema5bQ60519 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sema5bQ60519 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sema5bQ60519 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sema5bQ60519 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sema5bQ60519 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sema5bQ60519 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sema5bQ60519 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Sema5bQ60519 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sema5bQ60519 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sema5bQ60519 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Sema5bQ60519 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sema5bQ60519 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sema5bQ60519 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sema5bQ60519 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sema5bQ60519 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sema5bQ60519 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sema5bQ60519 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sema5bQ60519 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sema5bQ60519 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sema5bQ60519 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sema5bQ60519 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sema5bQ60519 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sema5bQ60519 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sema5bQ60519 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sema5bQ60519 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sema5bQ60519 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sema5bQ60519 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sema5bQ60519 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sema5bQ60519 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sema5bQ60519 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sema5bQ60519 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Sema5bQ60519 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sema5bQ60519 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sema5bQ60519 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sema5bQ60519 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sema5bQ60519 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sema5bQ60519 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sema5bQ60519 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sema5bQ60519 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sema5bQ60519 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sema5bQ60519 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Sema5bQ60519 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sema5bQ60519 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sema5bQ60519 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sema5bQ60519 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Sema5bQ60519 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sema5bQ60519 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sema5bQ60519 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sema5bQ60519 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sema5bQ60519 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sema5bQ60519 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sema5bQ60519 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sema5bQ60519 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sema5bQ60519 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sema5bQ60519 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sema5bQ60519 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sema5bQ60519 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sema5bQ60519 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sema5bQ60519 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sema5bQ60519 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sema5bQ60519 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sema5bQ60519 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sema5bQ60519 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sema5bQ60519 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sema5bQ60519 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sema5bQ60519 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Sema5bQ60519 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sema5bQ60519 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sema5bQ60519 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sema5bQ60519 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sema5bQ60519 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sema5bQ60519 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Sema5bQ60519 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sema5bQ60519 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sema5bQ60519 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sema5bQ60519 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sema5bQ60519 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sema5bQ60519 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sema5bQ60519 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sema5bQ60519 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sema5bQ60519 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sema5bQ60519 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sema5bQ60519 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sema5bQ60519 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sema5bQ60519 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sema5bQ60519 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sema5bQ60519 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.1 ms