Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGU6

Rtp3, Receptor-transporting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp3Q5QGU6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rtp3Q5QGU6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rtp3Q5QGU6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rtp3Q5QGU6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rtp3Q5QGU6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rtp3Q5QGU6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Rtp3Q5QGU6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rtp3Q5QGU6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rtp3Q5QGU6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rtp3Q5QGU6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rtp3Q5QGU6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rtp3Q5QGU6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rtp3Q5QGU6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rtp3Q5QGU6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rtp3Q5QGU6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rtp3Q5QGU6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rtp3Q5QGU6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rtp3Q5QGU6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rtp3Q5QGU6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rtp3Q5QGU6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rtp3Q5QGU6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rtp3Q5QGU6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rtp3Q5QGU6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rtp3Q5QGU6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rtp3Q5QGU6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rtp3Q5QGU6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rtp3Q5QGU6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rtp3Q5QGU6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rtp3Q5QGU6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rtp3Q5QGU6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rtp3Q5QGU6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rtp3Q5QGU6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rtp3Q5QGU6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rtp3Q5QGU6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rtp3Q5QGU6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rtp3Q5QGU6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rtp3Q5QGU6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rtp3Q5QGU6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rtp3Q5QGU6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rtp3Q5QGU6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rtp3Q5QGU6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rtp3Q5QGU6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rtp3Q5QGU6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rtp3Q5QGU6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rtp3Q5QGU6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rtp3Q5QGU6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rtp3Q5QGU6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rtp3Q5QGU6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rtp3Q5QGU6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rtp3Q5QGU6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rtp3Q5QGU6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rtp3Q5QGU6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rtp3Q5QGU6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rtp3Q5QGU6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rtp3Q5QGU6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rtp3Q5QGU6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rtp3Q5QGU6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rtp3Q5QGU6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rtp3Q5QGU6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rtp3Q5QGU6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rtp3Q5QGU6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rtp3Q5QGU6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rtp3Q5QGU6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rtp3Q5QGU6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rtp3Q5QGU6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rtp3Q5QGU6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rtp3Q5QGU6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rtp3Q5QGU6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rtp3Q5QGU6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rtp3Q5QGU6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rtp3Q5QGU6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rtp3Q5QGU6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rtp3Q5QGU6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rtp3Q5QGU6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rtp3Q5QGU6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rtp3Q5QGU6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rtp3Q5QGU6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rtp3Q5QGU6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rtp3Q5QGU6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rtp3Q5QGU6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rtp3Q5QGU6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rtp3Q5QGU6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Rtp3Q5QGU6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rtp3Q5QGU6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rtp3Q5QGU6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rtp3Q5QGU6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rtp3Q5QGU6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Rtp3Q5QGU6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rtp3Q5QGU6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rtp3Q5QGU6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rtp3Q5QGU6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rtp3Q5QGU6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rtp3Q5QGU6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rtp3Q5QGU6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Rtp3Q5QGU6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rtp3Q5QGU6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rtp3Q5QGU6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rtp3Q5QGU6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rtp3Q5QGU6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rtp3Q5QGU6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms