Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SynaQ5G5D5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SynaQ5G5D5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SynaQ5G5D5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SynaQ5G5D5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SynaQ5G5D5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SynaQ5G5D5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SynaQ5G5D5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SynaQ5G5D5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SynaQ5G5D5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SynaQ5G5D5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SynaQ5G5D5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SynaQ5G5D5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SynaQ5G5D5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SynaQ5G5D5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SynaQ5G5D5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SynaQ5G5D5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SynaQ5G5D5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SynaQ5G5D5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SynaQ5G5D5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SynaQ5G5D5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SynaQ5G5D5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SynaQ5G5D5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SynaQ5G5D5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SynaQ5G5D5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SynaQ5G5D5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SynaQ5G5D5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SynaQ5G5D5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SynaQ5G5D5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SynaQ5G5D5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SynaQ5G5D5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SynaQ5G5D5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SynaQ5G5D5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SynaQ5G5D5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SynaQ5G5D5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SynaQ5G5D5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SynaQ5G5D5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SynaQ5G5D5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SynaQ5G5D5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SynaQ5G5D5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SynaQ5G5D5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SynaQ5G5D5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SynaQ5G5D5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SynaQ5G5D5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SynaQ5G5D5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SynaQ5G5D5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SynaQ5G5D5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SynaQ5G5D5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SynaQ5G5D5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SynaQ5G5D5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SynaQ5G5D5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SynaQ5G5D5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SynaQ5G5D5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SynaQ5G5D5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SynaQ5G5D5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SynaQ5G5D5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SynaQ5G5D5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SynaQ5G5D5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SynaQ5G5D5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SynaQ5G5D5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
SynaQ5G5D5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SynaQ5G5D5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SynaQ5G5D5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SynaQ5G5D5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SynaQ5G5D5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SynaQ5G5D5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SynaQ5G5D5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SynaQ5G5D5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SynaQ5G5D5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SynaQ5G5D5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SynaQ5G5D5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SynaQ5G5D5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SynaQ5G5D5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SynaQ5G5D5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SynaQ5G5D5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SynaQ5G5D5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SynaQ5G5D5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SynaQ5G5D5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SynaQ5G5D5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SynaQ5G5D5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SynaQ5G5D5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SynaQ5G5D5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SynaQ5G5D5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SynaQ5G5D5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SynaQ5G5D5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SynaQ5G5D5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SynaQ5G5D5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SynaQ5G5D5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SynaQ5G5D5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SynaQ5G5D5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SynaQ5G5D5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SynaQ5G5D5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SynaQ5G5D5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SynaQ5G5D5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SynaQ5G5D5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SynaQ5G5D5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SynaQ5G5D5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SynaQ5G5D5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SynaQ5G5D5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SynaQ5G5D5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms