Protein–RNA interactions for Protein: Q4U2R1

Herc2, E3 ubiquitin-protein ligase HERC2, mousemouse

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Length 4,836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc2Q4U2R1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Herc2Q4U2R1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Herc2Q4U2R1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Herc2Q4U2R1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Herc2Q4U2R1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Herc2Q4U2R1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Herc2Q4U2R1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Herc2Q4U2R1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Herc2Q4U2R1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Herc2Q4U2R1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Herc2Q4U2R1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Herc2Q4U2R1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Herc2Q4U2R1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Herc2Q4U2R1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Herc2Q4U2R1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Herc2Q4U2R1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Herc2Q4U2R1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Herc2Q4U2R1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Herc2Q4U2R1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Herc2Q4U2R1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Herc2Q4U2R1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Herc2Q4U2R1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Herc2Q4U2R1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Herc2Q4U2R1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Herc2Q4U2R1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Herc2Q4U2R1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Herc2Q4U2R1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Herc2Q4U2R1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Herc2Q4U2R1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Herc2Q4U2R1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Herc2Q4U2R1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Herc2Q4U2R1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Herc2Q4U2R1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Herc2Q4U2R1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Herc2Q4U2R1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Herc2Q4U2R1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Herc2Q4U2R1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Herc2Q4U2R1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Herc2Q4U2R1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Herc2Q4U2R1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Herc2Q4U2R1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Herc2Q4U2R1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Herc2Q4U2R1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Herc2Q4U2R1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Herc2Q4U2R1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Herc2Q4U2R1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Herc2Q4U2R1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Herc2Q4U2R1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Herc2Q4U2R1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Herc2Q4U2R1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Herc2Q4U2R1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Herc2Q4U2R1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Herc2Q4U2R1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Herc2Q4U2R1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Herc2Q4U2R1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Herc2Q4U2R1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Herc2Q4U2R1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Herc2Q4U2R1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Herc2Q4U2R1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Herc2Q4U2R1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Herc2Q4U2R1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Herc2Q4U2R1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Herc2Q4U2R1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Herc2Q4U2R1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Herc2Q4U2R1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Herc2Q4U2R1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Herc2Q4U2R1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Herc2Q4U2R1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Herc2Q4U2R1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Herc2Q4U2R1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Herc2Q4U2R1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Herc2Q4U2R1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Herc2Q4U2R1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Herc2Q4U2R1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Herc2Q4U2R1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Herc2Q4U2R1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Herc2Q4U2R1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Herc2Q4U2R1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Herc2Q4U2R1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Herc2Q4U2R1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Herc2Q4U2R1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Herc2Q4U2R1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Herc2Q4U2R1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Herc2Q4U2R1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Herc2Q4U2R1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Herc2Q4U2R1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Herc2Q4U2R1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Herc2Q4U2R1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Herc2Q4U2R1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Herc2Q4U2R1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Herc2Q4U2R1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Herc2Q4U2R1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Herc2Q4U2R1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Herc2Q4U2R1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Herc2Q4U2R1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Herc2Q4U2R1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Herc2Q4U2R1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Herc2Q4U2R1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Herc2Q4U2R1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Herc2Q4U2R1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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