Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZF3

Ddx49, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx49Q4FZF3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ddx49Q4FZF3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ddx49Q4FZF3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ddx49Q4FZF3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ddx49Q4FZF3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ddx49Q4FZF3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ddx49Q4FZF3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ddx49Q4FZF3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ddx49Q4FZF3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ddx49Q4FZF3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ddx49Q4FZF3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ddx49Q4FZF3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ddx49Q4FZF3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ddx49Q4FZF3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ddx49Q4FZF3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ddx49Q4FZF3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Ddx49Q4FZF3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ddx49Q4FZF3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ddx49Q4FZF3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Ddx49Q4FZF3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ddx49Q4FZF3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ddx49Q4FZF3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ddx49Q4FZF3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ddx49Q4FZF3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ddx49Q4FZF3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ddx49Q4FZF3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ddx49Q4FZF3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ddx49Q4FZF3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ddx49Q4FZF3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ddx49Q4FZF3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ddx49Q4FZF3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ddx49Q4FZF3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ddx49Q4FZF3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ddx49Q4FZF3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ddx49Q4FZF3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ddx49Q4FZF3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ddx49Q4FZF3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ddx49Q4FZF3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ddx49Q4FZF3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ddx49Q4FZF3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ddx49Q4FZF3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ddx49Q4FZF3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ddx49Q4FZF3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ddx49Q4FZF3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ddx49Q4FZF3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ddx49Q4FZF3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ddx49Q4FZF3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ddx49Q4FZF3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ddx49Q4FZF3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ddx49Q4FZF3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Ddx49Q4FZF3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Ddx49Q4FZF3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ddx49Q4FZF3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ddx49Q4FZF3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ddx49Q4FZF3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ddx49Q4FZF3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ddx49Q4FZF3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ddx49Q4FZF3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ddx49Q4FZF3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ddx49Q4FZF3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ddx49Q4FZF3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ddx49Q4FZF3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ddx49Q4FZF3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ddx49Q4FZF3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ddx49Q4FZF3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ddx49Q4FZF3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ddx49Q4FZF3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ddx49Q4FZF3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ddx49Q4FZF3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ddx49Q4FZF3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ddx49Q4FZF3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ddx49Q4FZF3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ddx49Q4FZF3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ddx49Q4FZF3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ddx49Q4FZF3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ddx49Q4FZF3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Ddx49Q4FZF3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ddx49Q4FZF3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ddx49Q4FZF3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ddx49Q4FZF3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ddx49Q4FZF3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ddx49Q4FZF3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ddx49Q4FZF3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ddx49Q4FZF3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ddx49Q4FZF3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ddx49Q4FZF3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ddx49Q4FZF3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Ddx49Q4FZF3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ddx49Q4FZF3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ddx49Q4FZF3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ddx49Q4FZF3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ddx49Q4FZF3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ddx49Q4FZF3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ddx49Q4FZF3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ddx49Q4FZF3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ddx49Q4FZF3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ddx49Q4FZF3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ddx49Q4FZF3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ddx49Q4FZF3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ddx49Q4FZF3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms