Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1T4

P3h1, Prolyl 3-hydroxylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3h1Q3V1T4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
P3h1Q3V1T4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
P3h1Q3V1T4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
P3h1Q3V1T4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
P3h1Q3V1T4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
P3h1Q3V1T4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
P3h1Q3V1T4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
P3h1Q3V1T4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
P3h1Q3V1T4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
P3h1Q3V1T4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
P3h1Q3V1T4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
P3h1Q3V1T4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
P3h1Q3V1T4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
P3h1Q3V1T4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
P3h1Q3V1T4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
P3h1Q3V1T4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
P3h1Q3V1T4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
P3h1Q3V1T4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
P3h1Q3V1T4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
P3h1Q3V1T4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
P3h1Q3V1T4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
P3h1Q3V1T4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
P3h1Q3V1T4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
P3h1Q3V1T4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
P3h1Q3V1T4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
P3h1Q3V1T4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
P3h1Q3V1T4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
P3h1Q3V1T4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
P3h1Q3V1T4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
P3h1Q3V1T4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
P3h1Q3V1T4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
P3h1Q3V1T4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
P3h1Q3V1T4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
P3h1Q3V1T4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
P3h1Q3V1T4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
P3h1Q3V1T4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
P3h1Q3V1T4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
P3h1Q3V1T4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
P3h1Q3V1T4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
P3h1Q3V1T4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
P3h1Q3V1T4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
P3h1Q3V1T4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
P3h1Q3V1T4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
P3h1Q3V1T4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
P3h1Q3V1T4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
P3h1Q3V1T4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
P3h1Q3V1T4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
P3h1Q3V1T4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
P3h1Q3V1T4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
P3h1Q3V1T4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
P3h1Q3V1T4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
P3h1Q3V1T4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
P3h1Q3V1T4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
P3h1Q3V1T4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
P3h1Q3V1T4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
P3h1Q3V1T4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
P3h1Q3V1T4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
P3h1Q3V1T4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
P3h1Q3V1T4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
P3h1Q3V1T4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
P3h1Q3V1T4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
P3h1Q3V1T4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
P3h1Q3V1T4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
P3h1Q3V1T4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
P3h1Q3V1T4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
P3h1Q3V1T4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
P3h1Q3V1T4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
P3h1Q3V1T4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
P3h1Q3V1T4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
P3h1Q3V1T4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
P3h1Q3V1T4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
P3h1Q3V1T4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
P3h1Q3V1T4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
P3h1Q3V1T4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
P3h1Q3V1T4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
P3h1Q3V1T4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
P3h1Q3V1T4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
P3h1Q3V1T4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
P3h1Q3V1T4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
P3h1Q3V1T4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
P3h1Q3V1T4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
P3h1Q3V1T4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
P3h1Q3V1T4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
P3h1Q3V1T4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
P3h1Q3V1T4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
P3h1Q3V1T4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
P3h1Q3V1T4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
P3h1Q3V1T4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
P3h1Q3V1T4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
P3h1Q3V1T4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
P3h1Q3V1T4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
P3h1Q3V1T4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
P3h1Q3V1T4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
P3h1Q3V1T4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
P3h1Q3V1T4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
P3h1Q3V1T4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
P3h1Q3V1T4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
P3h1Q3V1T4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
P3h1Q3V1T4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
P3h1Q3V1T4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 314.7 ms