Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0E1

Uncharacterized protein C9orf131 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3V0E1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Q3V0E1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Q3V0E1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Q3V0E1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Q3V0E1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Q3V0E1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Q3V0E1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Q3V0E1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Q3V0E1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Q3V0E1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q3V0E1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q3V0E1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q3V0E1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q3V0E1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Q3V0E1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Q3V0E1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Q3V0E1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Q3V0E1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q3V0E1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q3V0E1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q3V0E1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q3V0E1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q3V0E1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q3V0E1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q3V0E1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q3V0E1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q3V0E1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q3V0E1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Q3V0E1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Q3V0E1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Q3V0E1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Q3V0E1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q3V0E1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q3V0E1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Q3V0E1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Q3V0E1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Q3V0E1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Q3V0E1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Q3V0E1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Q3V0E1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q3V0E1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q3V0E1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q3V0E1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q3V0E1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Q3V0E1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q3V0E1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Q3V0E1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q3V0E1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q3V0E1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q3V0E1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Q3V0E1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Q3V0E1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Q3V0E1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Q3V0E1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Q3V0E1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q3V0E1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q3V0E1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Q3V0E1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Q3V0E1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Q3V0E1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Q3V0E1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Q3V0E1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Q3V0E1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Q3V0E1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Q3V0E1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Q3V0E1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Q3V0E1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Q3V0E1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Q3V0E1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Q3V0E1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Q3V0E1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Q3V0E1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Q3V0E1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Q3V0E1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Q3V0E1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Q3V0E1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Q3V0E1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Q3V0E1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Q3V0E1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Q3V0E1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Q3V0E1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Q3V0E1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Q3V0E1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Q3V0E1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Q3V0E1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Q3V0E1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Q3V0E1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Q3V0E1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Q3V0E1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Q3V0E1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Q3V0E1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Q3V0E1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Q3V0E1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Q3V0E1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Q3V0E1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Q3V0E1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Q3V0E1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Q3V0E1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Q3V0E1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Q3V0E1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms