Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Ccdc27Q3V036 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Ccdc27Q3V036 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Ccdc27Q3V036 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Ccdc27Q3V036 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Ccdc27Q3V036 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Ccdc27Q3V036 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Ccdc27Q3V036 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Ccdc27Q3V036 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
Ccdc27Q3V036 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Ccdc27Q3V036 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Ccdc27Q3V036 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Ccdc27Q3V036 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Ccdc27Q3V036 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Ccdc27Q3V036 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Ccdc27Q3V036 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Ccdc27Q3V036 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
Ccdc27Q3V036 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Ccdc27Q3V036 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Ccdc27Q3V036 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Ccdc27Q3V036 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Ccdc27Q3V036 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Ccdc27Q3V036 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Ccdc27Q3V036 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Ccdc27Q3V036 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Ccdc27Q3V036 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Ccdc27Q3V036 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Ccdc27Q3V036 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Ccdc27Q3V036 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Ccdc27Q3V036 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Ccdc27Q3V036 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Ccdc27Q3V036 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Ccdc27Q3V036 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Ccdc27Q3V036 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Ccdc27Q3V036 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Ccdc27Q3V036 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Ccdc27Q3V036 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Ccdc27Q3V036 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Ccdc27Q3V036 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Ccdc27Q3V036 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Ccdc27Q3V036 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Ccdc27Q3V036 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Ccdc27Q3V036 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
Ccdc27Q3V036 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ccdc27Q3V036 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ccdc27Q3V036 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Ccdc27Q3V036 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Ccdc27Q3V036 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ccdc27Q3V036 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ccdc27Q3V036 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ccdc27Q3V036 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ccdc27Q3V036 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ccdc27Q3V036 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ccdc27Q3V036 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ccdc27Q3V036 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Ccdc27Q3V036 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
Ccdc27Q3V036 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Ccdc27Q3V036 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Ccdc27Q3V036 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Ccdc27Q3V036 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ccdc27Q3V036 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ccdc27Q3V036 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ccdc27Q3V036 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ccdc27Q3V036 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ccdc27Q3V036 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Ccdc27Q3V036 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Ccdc27Q3V036 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Ccdc27Q3V036 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ccdc27Q3V036 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
Ccdc27Q3V036 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Ccdc27Q3V036 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ccdc27Q3V036 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ccdc27Q3V036 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ccdc27Q3V036 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ccdc27Q3V036 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ccdc27Q3V036 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ccdc27Q3V036 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Ccdc27Q3V036 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ccdc27Q3V036 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ccdc27Q3V036 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ccdc27Q3V036 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ccdc27Q3V036 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ccdc27Q3V036 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Ccdc27Q3V036 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Ccdc27Q3V036 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Ccdc27Q3V036 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Ccdc27Q3V036 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Ccdc27Q3V036 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Ccdc27Q3V036 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Ccdc27Q3V036 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Ccdc27Q3V036 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Ccdc27Q3V036 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Ccdc27Q3V036 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Ccdc27Q3V036 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Ccdc27Q3V036 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Ccdc27Q3V036 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Ccdc27Q3V036 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Ccdc27Q3V036 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Ccdc27Q3V036 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Ccdc27Q3V036 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms