Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rnpc3Q3UZ01 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rnpc3Q3UZ01 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rnpc3Q3UZ01 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rnpc3Q3UZ01 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rnpc3Q3UZ01 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rnpc3Q3UZ01 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rnpc3Q3UZ01 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rnpc3Q3UZ01 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rnpc3Q3UZ01 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rnpc3Q3UZ01 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rnpc3Q3UZ01 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Rnpc3Q3UZ01 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rnpc3Q3UZ01 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rnpc3Q3UZ01 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rnpc3Q3UZ01 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rnpc3Q3UZ01 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rnpc3Q3UZ01 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rnpc3Q3UZ01 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rnpc3Q3UZ01 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rnpc3Q3UZ01 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rnpc3Q3UZ01 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rnpc3Q3UZ01 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rnpc3Q3UZ01 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rnpc3Q3UZ01 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rnpc3Q3UZ01 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rnpc3Q3UZ01 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rnpc3Q3UZ01 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rnpc3Q3UZ01 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rnpc3Q3UZ01 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rnpc3Q3UZ01 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rnpc3Q3UZ01 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rnpc3Q3UZ01 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Rnpc3Q3UZ01 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Rnpc3Q3UZ01 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Rnpc3Q3UZ01 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rnpc3Q3UZ01 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rnpc3Q3UZ01 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rnpc3Q3UZ01 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Rnpc3Q3UZ01 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Rnpc3Q3UZ01 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rnpc3Q3UZ01 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rnpc3Q3UZ01 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rnpc3Q3UZ01 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rnpc3Q3UZ01 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rnpc3Q3UZ01 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rnpc3Q3UZ01 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rnpc3Q3UZ01 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rnpc3Q3UZ01 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rnpc3Q3UZ01 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rnpc3Q3UZ01 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rnpc3Q3UZ01 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rnpc3Q3UZ01 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Rnpc3Q3UZ01 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rnpc3Q3UZ01 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rnpc3Q3UZ01 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rnpc3Q3UZ01 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Rnpc3Q3UZ01 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rnpc3Q3UZ01 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rnpc3Q3UZ01 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rnpc3Q3UZ01 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rnpc3Q3UZ01 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rnpc3Q3UZ01 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rnpc3Q3UZ01 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rnpc3Q3UZ01 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rnpc3Q3UZ01 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rnpc3Q3UZ01 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rnpc3Q3UZ01 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rnpc3Q3UZ01 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rnpc3Q3UZ01 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rnpc3Q3UZ01 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Rnpc3Q3UZ01 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Rnpc3Q3UZ01 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rnpc3Q3UZ01 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rnpc3Q3UZ01 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rnpc3Q3UZ01 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rnpc3Q3UZ01 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rnpc3Q3UZ01 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rnpc3Q3UZ01 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rnpc3Q3UZ01 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rnpc3Q3UZ01 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rnpc3Q3UZ01 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rnpc3Q3UZ01 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rnpc3Q3UZ01 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rnpc3Q3UZ01 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rnpc3Q3UZ01 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Rnpc3Q3UZ01 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rnpc3Q3UZ01 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rnpc3Q3UZ01 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rnpc3Q3UZ01 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rnpc3Q3UZ01 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rnpc3Q3UZ01 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rnpc3Q3UZ01 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rnpc3Q3UZ01 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Rnpc3Q3UZ01 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rnpc3Q3UZ01 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rnpc3Q3UZ01 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rnpc3Q3UZ01 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rnpc3Q3UZ01 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rnpc3Q3UZ01 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms