Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW21

Clpsl2, Colipase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clpsl2Q3UW21 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clpsl2Q3UW21 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clpsl2Q3UW21 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clpsl2Q3UW21 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Clpsl2Q3UW21 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clpsl2Q3UW21 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clpsl2Q3UW21 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clpsl2Q3UW21 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clpsl2Q3UW21 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Clpsl2Q3UW21 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Clpsl2Q3UW21 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clpsl2Q3UW21 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clpsl2Q3UW21 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clpsl2Q3UW21 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clpsl2Q3UW21 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Clpsl2Q3UW21 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clpsl2Q3UW21 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clpsl2Q3UW21 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clpsl2Q3UW21 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clpsl2Q3UW21 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Clpsl2Q3UW21 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Clpsl2Q3UW21 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Clpsl2Q3UW21 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clpsl2Q3UW21 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clpsl2Q3UW21 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clpsl2Q3UW21 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clpsl2Q3UW21 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clpsl2Q3UW21 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clpsl2Q3UW21 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clpsl2Q3UW21 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clpsl2Q3UW21 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clpsl2Q3UW21 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clpsl2Q3UW21 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clpsl2Q3UW21 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clpsl2Q3UW21 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clpsl2Q3UW21 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Clpsl2Q3UW21 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clpsl2Q3UW21 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clpsl2Q3UW21 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clpsl2Q3UW21 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clpsl2Q3UW21 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clpsl2Q3UW21 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clpsl2Q3UW21 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Clpsl2Q3UW21 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clpsl2Q3UW21 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clpsl2Q3UW21 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clpsl2Q3UW21 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clpsl2Q3UW21 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clpsl2Q3UW21 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clpsl2Q3UW21 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clpsl2Q3UW21 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clpsl2Q3UW21 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clpsl2Q3UW21 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clpsl2Q3UW21 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clpsl2Q3UW21 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clpsl2Q3UW21 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clpsl2Q3UW21 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clpsl2Q3UW21 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Clpsl2Q3UW21 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clpsl2Q3UW21 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clpsl2Q3UW21 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clpsl2Q3UW21 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clpsl2Q3UW21 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clpsl2Q3UW21 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clpsl2Q3UW21 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clpsl2Q3UW21 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clpsl2Q3UW21 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clpsl2Q3UW21 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clpsl2Q3UW21 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clpsl2Q3UW21 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clpsl2Q3UW21 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clpsl2Q3UW21 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clpsl2Q3UW21 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clpsl2Q3UW21 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clpsl2Q3UW21 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clpsl2Q3UW21 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clpsl2Q3UW21 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clpsl2Q3UW21 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clpsl2Q3UW21 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clpsl2Q3UW21 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clpsl2Q3UW21 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clpsl2Q3UW21 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clpsl2Q3UW21 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clpsl2Q3UW21 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clpsl2Q3UW21 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clpsl2Q3UW21 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Clpsl2Q3UW21 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clpsl2Q3UW21 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clpsl2Q3UW21 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clpsl2Q3UW21 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clpsl2Q3UW21 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clpsl2Q3UW21 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clpsl2Q3UW21 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clpsl2Q3UW21 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clpsl2Q3UW21 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clpsl2Q3UW21 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clpsl2Q3UW21 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clpsl2Q3UW21 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clpsl2Q3UW21 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clpsl2Q3UW21 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms