Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTQ7

Prdm10, PR domain zinc finger protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm10Q3UTQ7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Prdm10Q3UTQ7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Prdm10Q3UTQ7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Prdm10Q3UTQ7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
Prdm10Q3UTQ7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Prdm10Q3UTQ7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC34■■■■□ 3.03
Prdm10Q3UTQ7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Prdm10Q3UTQ7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Prdm10Q3UTQ7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Prdm10Q3UTQ7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Prdm10Q3UTQ7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Prdm10Q3UTQ7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Prdm10Q3UTQ7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Prdm10Q3UTQ7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Prdm10Q3UTQ7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Prdm10Q3UTQ7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Prdm10Q3UTQ7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Prdm10Q3UTQ7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Prdm10Q3UTQ7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Prdm10Q3UTQ7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Prdm10Q3UTQ7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Prdm10Q3UTQ7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Prdm10Q3UTQ7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Prdm10Q3UTQ7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Prdm10Q3UTQ7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Prdm10Q3UTQ7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Prdm10Q3UTQ7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Prdm10Q3UTQ7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Prdm10Q3UTQ7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Prdm10Q3UTQ7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Prdm10Q3UTQ7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC33.81■■■■□ 3
Prdm10Q3UTQ7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Prdm10Q3UTQ7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Prdm10Q3UTQ7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Prdm10Q3UTQ7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Prdm10Q3UTQ7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Prdm10Q3UTQ7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Prdm10Q3UTQ7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Prdm10Q3UTQ7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Prdm10Q3UTQ7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Prdm10Q3UTQ7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Prdm10Q3UTQ7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC33.77■■■■□ 3
Prdm10Q3UTQ7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Prdm10Q3UTQ7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Prdm10Q3UTQ7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
Prdm10Q3UTQ7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Prdm10Q3UTQ7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Prdm10Q3UTQ7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Prdm10Q3UTQ7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
Prdm10Q3UTQ7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Prdm10Q3UTQ7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Prdm10Q3UTQ7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Prdm10Q3UTQ7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Prdm10Q3UTQ7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Prdm10Q3UTQ7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Prdm10Q3UTQ7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Prdm10Q3UTQ7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Prdm10Q3UTQ7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Prdm10Q3UTQ7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Prdm10Q3UTQ7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Prdm10Q3UTQ7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Prdm10Q3UTQ7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Prdm10Q3UTQ7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Prdm10Q3UTQ7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Prdm10Q3UTQ7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Prdm10Q3UTQ7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Prdm10Q3UTQ7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Prdm10Q3UTQ7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Prdm10Q3UTQ7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Prdm10Q3UTQ7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Prdm10Q3UTQ7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Prdm10Q3UTQ7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Prdm10Q3UTQ7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Prdm10Q3UTQ7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Prdm10Q3UTQ7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Prdm10Q3UTQ7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Prdm10Q3UTQ7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
Prdm10Q3UTQ7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Prdm10Q3UTQ7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Prdm10Q3UTQ7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Prdm10Q3UTQ7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Prdm10Q3UTQ7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Prdm10Q3UTQ7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Prdm10Q3UTQ7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
Prdm10Q3UTQ7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Prdm10Q3UTQ7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Prdm10Q3UTQ7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Prdm10Q3UTQ7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Prdm10Q3UTQ7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Prdm10Q3UTQ7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Prdm10Q3UTQ7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Prdm10Q3UTQ7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Prdm10Q3UTQ7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
Prdm10Q3UTQ7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Prdm10Q3UTQ7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Prdm10Q3UTQ7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Prdm10Q3UTQ7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Prdm10Q3UTQ7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Prdm10Q3UTQ7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Prdm10Q3UTQ7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms