Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTH8

Arhgef9, Rho guanine nucleotide exchange factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef9Q3UTH8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Arhgef9Q3UTH8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Arhgef9Q3UTH8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Arhgef9Q3UTH8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Arhgef9Q3UTH8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Arhgef9Q3UTH8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arhgef9Q3UTH8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arhgef9Q3UTH8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arhgef9Q3UTH8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Arhgef9Q3UTH8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Arhgef9Q3UTH8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Arhgef9Q3UTH8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Arhgef9Q3UTH8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Arhgef9Q3UTH8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Arhgef9Q3UTH8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arhgef9Q3UTH8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arhgef9Q3UTH8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arhgef9Q3UTH8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Arhgef9Q3UTH8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Arhgef9Q3UTH8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arhgef9Q3UTH8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arhgef9Q3UTH8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arhgef9Q3UTH8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arhgef9Q3UTH8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Arhgef9Q3UTH8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Arhgef9Q3UTH8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arhgef9Q3UTH8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arhgef9Q3UTH8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arhgef9Q3UTH8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arhgef9Q3UTH8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Arhgef9Q3UTH8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Arhgef9Q3UTH8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Arhgef9Q3UTH8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Arhgef9Q3UTH8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Arhgef9Q3UTH8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Arhgef9Q3UTH8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Arhgef9Q3UTH8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Arhgef9Q3UTH8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Arhgef9Q3UTH8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Arhgef9Q3UTH8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Arhgef9Q3UTH8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Arhgef9Q3UTH8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Arhgef9Q3UTH8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Arhgef9Q3UTH8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Arhgef9Q3UTH8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Arhgef9Q3UTH8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Arhgef9Q3UTH8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Arhgef9Q3UTH8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Arhgef9Q3UTH8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Arhgef9Q3UTH8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Arhgef9Q3UTH8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Arhgef9Q3UTH8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Arhgef9Q3UTH8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Arhgef9Q3UTH8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Arhgef9Q3UTH8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Arhgef9Q3UTH8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Arhgef9Q3UTH8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Arhgef9Q3UTH8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Arhgef9Q3UTH8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Arhgef9Q3UTH8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Arhgef9Q3UTH8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Arhgef9Q3UTH8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Arhgef9Q3UTH8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Arhgef9Q3UTH8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Arhgef9Q3UTH8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Arhgef9Q3UTH8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Arhgef9Q3UTH8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Arhgef9Q3UTH8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Arhgef9Q3UTH8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Arhgef9Q3UTH8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arhgef9Q3UTH8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arhgef9Q3UTH8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Arhgef9Q3UTH8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Arhgef9Q3UTH8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Arhgef9Q3UTH8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Arhgef9Q3UTH8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Arhgef9Q3UTH8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arhgef9Q3UTH8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arhgef9Q3UTH8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arhgef9Q3UTH8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arhgef9Q3UTH8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Arhgef9Q3UTH8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Arhgef9Q3UTH8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Arhgef9Q3UTH8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Arhgef9Q3UTH8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Arhgef9Q3UTH8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Arhgef9Q3UTH8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Arhgef9Q3UTH8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Arhgef9Q3UTH8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Arhgef9Q3UTH8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Arhgef9Q3UTH8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Arhgef9Q3UTH8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Arhgef9Q3UTH8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Arhgef9Q3UTH8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arhgef9Q3UTH8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arhgef9Q3UTH8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arhgef9Q3UTH8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arhgef9Q3UTH8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Arhgef9Q3UTH8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Arhgef9Q3UTH8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms