Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Fchsd2Q3USJ8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Fchsd2Q3USJ8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Fchsd2Q3USJ8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Fchsd2Q3USJ8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Fchsd2Q3USJ8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Fchsd2Q3USJ8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Fchsd2Q3USJ8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Fchsd2Q3USJ8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Fchsd2Q3USJ8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Fchsd2Q3USJ8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Fchsd2Q3USJ8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Fchsd2Q3USJ8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Fchsd2Q3USJ8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Fchsd2Q3USJ8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
Fchsd2Q3USJ8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Fchsd2Q3USJ8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Fchsd2Q3USJ8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Fchsd2Q3USJ8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Fchsd2Q3USJ8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Fchsd2Q3USJ8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Fchsd2Q3USJ8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Fchsd2Q3USJ8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Fchsd2Q3USJ8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Fchsd2Q3USJ8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Fchsd2Q3USJ8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Fchsd2Q3USJ8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Fchsd2Q3USJ8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
Fchsd2Q3USJ8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
Fchsd2Q3USJ8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Fchsd2Q3USJ8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Fchsd2Q3USJ8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
Fchsd2Q3USJ8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Fchsd2Q3USJ8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Fchsd2Q3USJ8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Fchsd2Q3USJ8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Fchsd2Q3USJ8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Fchsd2Q3USJ8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Fchsd2Q3USJ8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Fchsd2Q3USJ8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Fchsd2Q3USJ8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Fchsd2Q3USJ8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Fchsd2Q3USJ8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Fchsd2Q3USJ8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Fchsd2Q3USJ8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Fchsd2Q3USJ8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Fchsd2Q3USJ8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Fchsd2Q3USJ8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Fchsd2Q3USJ8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Fchsd2Q3USJ8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Fchsd2Q3USJ8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Fchsd2Q3USJ8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Fchsd2Q3USJ8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
Fchsd2Q3USJ8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Fchsd2Q3USJ8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Fchsd2Q3USJ8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Fchsd2Q3USJ8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Fchsd2Q3USJ8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Fchsd2Q3USJ8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Fchsd2Q3USJ8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Fchsd2Q3USJ8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Fchsd2Q3USJ8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Fchsd2Q3USJ8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Fchsd2Q3USJ8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Fchsd2Q3USJ8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Fchsd2Q3USJ8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Fchsd2Q3USJ8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Fchsd2Q3USJ8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Fchsd2Q3USJ8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Fchsd2Q3USJ8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Fchsd2Q3USJ8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Fchsd2Q3USJ8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Fchsd2Q3USJ8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Fchsd2Q3USJ8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Fchsd2Q3USJ8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
Fchsd2Q3USJ8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Fchsd2Q3USJ8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Fchsd2Q3USJ8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Fchsd2Q3USJ8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Fchsd2Q3USJ8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Fchsd2Q3USJ8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Fchsd2Q3USJ8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Fchsd2Q3USJ8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Fchsd2Q3USJ8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Fchsd2Q3USJ8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Fchsd2Q3USJ8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Fchsd2Q3USJ8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Fchsd2Q3USJ8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
Fchsd2Q3USJ8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
Fchsd2Q3USJ8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Fchsd2Q3USJ8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Fchsd2Q3USJ8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Fchsd2Q3USJ8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Fchsd2Q3USJ8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Fchsd2Q3USJ8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Fchsd2Q3USJ8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Fchsd2Q3USJ8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Fchsd2Q3USJ8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Fchsd2Q3USJ8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Fchsd2Q3USJ8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms