Protein–RNA interactions for Protein: Q3URS2

Zscan4f, Zinc finger and SCAN domain containing protein 4F, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan4fQ3URS2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Zscan4fQ3URS2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Zscan4fQ3URS2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Zscan4fQ3URS2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Zscan4fQ3URS2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Zscan4fQ3URS2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Zscan4fQ3URS2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Zscan4fQ3URS2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Zscan4fQ3URS2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Zscan4fQ3URS2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Zscan4fQ3URS2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Zscan4fQ3URS2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Zscan4fQ3URS2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Zscan4fQ3URS2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Zscan4fQ3URS2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Zscan4fQ3URS2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Zscan4fQ3URS2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Zscan4fQ3URS2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Zscan4fQ3URS2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Zscan4fQ3URS2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Zscan4fQ3URS2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Zscan4fQ3URS2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Zscan4fQ3URS2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Zscan4fQ3URS2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Zscan4fQ3URS2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Zscan4fQ3URS2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Zscan4fQ3URS2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Zscan4fQ3URS2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Zscan4fQ3URS2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Zscan4fQ3URS2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Zscan4fQ3URS2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Zscan4fQ3URS2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Zscan4fQ3URS2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Zscan4fQ3URS2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Zscan4fQ3URS2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Zscan4fQ3URS2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Zscan4fQ3URS2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Zscan4fQ3URS2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Zscan4fQ3URS2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Zscan4fQ3URS2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Zscan4fQ3URS2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Zscan4fQ3URS2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Zscan4fQ3URS2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Zscan4fQ3URS2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Zscan4fQ3URS2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Zscan4fQ3URS2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Zscan4fQ3URS2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Zscan4fQ3URS2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Zscan4fQ3URS2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Zscan4fQ3URS2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Zscan4fQ3URS2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Zscan4fQ3URS2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Zscan4fQ3URS2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Zscan4fQ3URS2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Zscan4fQ3URS2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Zscan4fQ3URS2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Zscan4fQ3URS2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Zscan4fQ3URS2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Zscan4fQ3URS2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Zscan4fQ3URS2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Zscan4fQ3URS2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Zscan4fQ3URS2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Zscan4fQ3URS2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Zscan4fQ3URS2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Zscan4fQ3URS2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Zscan4fQ3URS2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Zscan4fQ3URS2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Zscan4fQ3URS2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Zscan4fQ3URS2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Zscan4fQ3URS2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Zscan4fQ3URS2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Zscan4fQ3URS2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Zscan4fQ3URS2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Zscan4fQ3URS2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Zscan4fQ3URS2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Zscan4fQ3URS2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Zscan4fQ3URS2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Zscan4fQ3URS2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Zscan4fQ3URS2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Zscan4fQ3URS2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Zscan4fQ3URS2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Zscan4fQ3URS2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Zscan4fQ3URS2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Zscan4fQ3URS2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Zscan4fQ3URS2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Zscan4fQ3URS2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Zscan4fQ3URS2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Zscan4fQ3URS2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Zscan4fQ3URS2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Zscan4fQ3URS2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Zscan4fQ3URS2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Zscan4fQ3URS2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Zscan4fQ3URS2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Zscan4fQ3URS2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Zscan4fQ3URS2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Zscan4fQ3URS2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Zscan4fQ3URS2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Zscan4fQ3URS2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Zscan4fQ3URS2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Zscan4fQ3URS2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms